RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 STIP1P31948 543 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 COILP38432 576 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 RPIAP49247 311 aa11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 IRAK1P51617 712 aa11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 SGSHP51688 502 aa11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 PER3P56645 1201 aa11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 DR1Q01658 176 aa11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 GNA12Q03113 381 aa11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
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CAPNS1-209ENST00000590049 CYP1B1Q16678 543 aa11.6□□□□□ -0.55
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CAPNS1-209ENST00000590049 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
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CAPNS1-209ENST00000590049 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 CCDC89Q8N998 374 aa11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 CCHCR1Q8TD31 782 aa11.6□□□□□ -0.55
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CAPNS1-209ENST00000590049 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 MAGEH1Q9H213 219 aa11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 MAP10Q9P2G4 905 aa11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 GGT7Q9UJ14 662 aa11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 DNPEPQ9ULA0 475 aa11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 PLA2G4CQ9UP65 541 aa11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 NEU3Q9UQ49 428 aa11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 DMTF1Q9Y222 760 aa11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 KCTD3Q9Y597 815 aa11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 EFCAB8A8MWE9 144 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 KCNN4O15554 427 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 GRID2O43424 1007 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 PENKP01210 267 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 GARSP41250 739 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.552e-14■■□□□ 13.1
CAPNS1-209ENST00000590049 PPP2CBP62714 309 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 PPP2CAP67775 309 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 LTBQ06643 244 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 GALNT2Q10471 571 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC12A1Q13621 1099 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 FYB2Q5VWT5 728 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 PRIMA1Q86XR5 153 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 BBS5Q8N3I7 341 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 MMGT1Q8N4V1 131 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 NPWQ8N729 165 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 OR14C36Q8NHC7 312 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 FIBINQ8TAL6 211 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC35B2Q8TB61 432 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 UBXN4Q92575 508 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 MYEOVQ96EZ4 313 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 SPON2Q9BUD6 331 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC2A11Q9BYW1 496 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC39A8Q9C0K1 460 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 RAB17Q9H0T7 212 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 ATP13A1Q9HD20 1204 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 VPS28Q9UK41 221 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CAPNS1-209ENST00000590049 DOCK4Q8N1I0 1966 aa11.58□□□□□ -0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM187AA6NFU0 413 aa11.58□□□□□ -0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 CBX6O95503 412 aa11.58□□□□□ -0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 IFNB1P01574 187 aa11.58□□□□□ -0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 BPIP17213 487 aa11.58□□□□□ -0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 CCNCP24863 283 aa11.58□□□□□ -0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 KCNJ1P48048 391 aa11.58□□□□□ -0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 ADPRHP54922 357 aa11.58□□□□□ -0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 NR6A1Q15406 480 aa11.58□□□□□ -0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 NADK2Q4G0N4 442 aa11.58□□□□□ -0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM215Q68D42 235 aa11.58□□□□□ -0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa11.58□□□□□ -0.56
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CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM121Q9BTD3 319 aa11.58□□□□□ -0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
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CAPNS1-209ENST00000590049 CAAP1Q9H8G2 361 aa11.58□□□□□ -0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 CYP4F12Q9HCS2 524 aa11.58□□□□□ -0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 NDFIP2Q9NV92 336 aa11.58□□□□□ -0.56
CAPNS1-209ENST00000590049 PCYOX1Q9UHG3 505 aa11.58□□□□□ -0.56
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