RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
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CAPNS1-205ENST00000588780 F8VZ95 297 aa21.6■■□□□ 1.05
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CAPNS1-205ENST00000588780 EPHA4P54764 986 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-205ENST00000588780 CDR2Q01850 454 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-205ENST00000588780 SEMA5AQ13591 1074 aa21.6■■□□□ 1.05
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CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF235Q14590 738 aa21.6■■□□□ 1.05
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CAPNS1-205ENST00000588780 TCP11X1B4DZS4 312 aa21.59■■□□□ 1.05
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CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-205ENST00000588780 TSPAN33Q86UF1 283 aa21.59■■□□□ 1.05
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CAPNS1-205ENST00000588780 EPB41L1Q9H4G0 881 aa21.59■■□□□ 1.05
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CAPNS1-205ENST00000588780 C9orf72Q96LT7 481 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-205ENST00000588780 MCEEQ96PE7 176 aa21.57■■□□□ 1.04
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CAPNS1-205ENST00000588780 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-205ENST00000588780 ABCG8Q9H221 673 aa21.57■■□□□ 1.04
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