RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582376.1

GGA3-212, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-212ENST00000582376 TBCBQ99426 244 aa9.13□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 RETREG1Q9H6L5 497 aa9.13□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 KCTD5Q9NXV2 234 aa9.13□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 LHX3Q9UBR4 397 aa9.13□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa9.13□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 RARRES3Q9UL19 164 aa9.13□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 ZGRF1Q86YA3 2104 aa9.13□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 FAM221AA4D161 298 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 GOLGA6BA6NDN3 693 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 LILRA5A6NI73 299 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 TMEM200CA6NKL6 621 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 A8MX80 341 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 GRID2O43424 1007 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 YEATS4O95619 227 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 ERBB2P04626 1255 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 MYL1P05976 194 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 SLC2A4P14672 509 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 RHOQP17081 205 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 GNA15P30679 374 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 FMO5P49326 533 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 SNX16P57768 344 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 PYCR3Q53H96 274 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 IZUMO3Q5VZ72 239 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 RESP18Q5W5W9 173 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 RAET1GQ6H3X3 334 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 IYDQ6PHW0 289 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 TAOK1Q7L7X3 1001 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 PRSS42Q7Z5A4 293 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 GALNT13Q8IUC8 556 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 ARHGEF19Q8IW93 802 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 AVL9Q8NBF6 648 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 GRHL3Q8TE85 626 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 CHTF18Q8WVB6 975 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 FAR1Q8WVX9 515 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 MR1Q95460 341 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 NT5C3BQ969T7 300 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 SLC35C1Q96A29 364 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 COQ10AQ96MF6 247 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 TMEM248Q9NWD8 314 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 CNTN6Q9UQ52 1028 aa9.12□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 MYO7BQ6PIF6 2116 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 FER1L5A0AVI2 2057 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 A0A0G2JNG1 304 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 KIR2DS3K7RE56 304 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 IPO13O94829 963 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 TYRP1P17643 537 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 AMD1P17707 334 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 SYT1P21579 422 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 TEAD1P28347 426 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 SERPINA4P29622 427 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 TLE4Q04727 773 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 CETN1Q12798 172 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 TUBB3Q13509 450 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 ATP1A4Q13733 1029 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 KIR2DS5Q14953 304 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 CYTH1Q15438 398 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 SLC25A52Q3SY17 297 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 CACHD1Q5VU97 1274 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 RPTNQ6XPR3 784 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 FAM131BQ86XD5 332 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 WDTC1Q8N5D0 677 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 ZBTB2Q8N680 514 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 KLHL6Q8WZ60 621 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 CCDC120Q96HB5 630 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 KREMEN1Q96MU8 473 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 HERPUD2Q9BSE4 406 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 SYNCQ9H7C4 482 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 MCCC2Q9HCC0 563 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 WASH6PQ9NQA3 447 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 OGFRQ9NZT2 677 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 CPNE7Q9UBL6 633 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 TBC1D29Q9UFV1 150 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 TCFL5Q9UL49 500 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 NEU2Q9Y3R4 380 aa9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 PMM2O15305 246 aa9.1□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 SNX2O60749 519 aa9.1□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 UBXN7O94888 489 aa9.1□□□□□ -0.95
GGA3-212ENST00000582376 RAB40ALP0C0E4 278 aa9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms