RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 FICDQ9BVA6 458 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 GPR27Q9NS67 375 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 ZNF711Q9Y462 761 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa9.87□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 POM121BA6NF01 834 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 A6NNZ2 444 aa9.86□□□□□ -0.83
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GGA3-209ENST00000580646 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 SDC3O75056 442 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 PRKCGP05129 697 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa9.86□□□□□ -0.83
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GGA3-209ENST00000580646 PDE1BQ01064 536 aa9.86□□□□□ -0.83
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GGA3-209ENST00000580646 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
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GGA3-209ENST00000580646 PTK6Q13882 451 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 LRRC14Q15048 493 aa9.86□□□□□ -0.83
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GGA3-209ENST00000580646 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa9.86□□□□□ -0.83
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GGA3-209ENST00000580646 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 TSPAN33Q86UF1 283 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 SLC25A45Q8N413 288 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 SPATA4Q8NEY3 305 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 NUS1Q96E22 293 aa9.86□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP9.86□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 PKD2L2Q9NZM6 624 aa9.86□□□□□ -0.83
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GGA3-209ENST00000580646 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa9.86□□□□□ -0.83
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GGA3-209ENST00000580646 URI1O94763 535 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 CLDN7O95471 211 aa9.85□□□□□ -0.83
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GGA3-209ENST00000580646 TSHRP16473 764 aa9.85□□□□□ -0.83
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GGA3-209ENST00000580646 C2orf81A6NN90 581 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 F5H423 210 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
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GGA3-209ENST00000580646 SIGLEC6O43699 453 aa9.84□□□□□ -0.83
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GGA3-209ENST00000580646 PIAS2O75928 621 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 CDK4P11802 303 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 MLNP12872 115 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 CKMT2P17540 419 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 PSMA3P25788 255 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 IGFALSP35858 605 aa9.84□□□□□ -0.83
GGA3-209ENST00000580646 ETV3P41162 512 aa9.84□□□□□ -0.83
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