RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 CAPN1P07384 714 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CYC1P08574 325 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 GSTA2P09210 222 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 VSIG10L2P0DP72 767 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 DARSP14868 501 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CPA1P15085 419 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 GYPEP15421 78 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CYP2B6P20813 491 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 AHCYP23526 432 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CTSSP25774 331 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CAPGP40121 348 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ADCYAP1R1P41586 468 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC15A1P46059 708 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 GPR3P46089 330 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 AVPR1BP47901 424 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KRT6CP48668 564 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 HSPA7P48741 367 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC9A3P48764 834 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CCT3P49368 545 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MECP2P51608 486 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CLCNKAP51800 687 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 BMXP51813 675 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 RAP1GDS1P52306 607 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGDIAP52565 204 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC7A2P52569 658 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 METAP1P53582 386 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 COPB1P53618 953 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CDH6P55285 790 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SCAND1P57086 179 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 GPX6P59796 221 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CREMQ03060 361 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 GAD2Q05329 585 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PPATQ06203 517 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF33BQ06732 778 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CBFBQ13951 182 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ANGPT1Q15389 498 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SEC23AQ15436 765 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ADRM1Q16186 407 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MAPK6Q16659 721 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KRT24Q2M2I5 525 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SMTNL2Q2TAL5 461 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP17Q68EM7 881 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SCYL2Q6P3W7 929 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NPNTQ6UXI9 565 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF365Q70YC5 407 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 EXOC3L1Q86VI1 746 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 DENND1CQ8IV53 801 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SCN4BQ8IWT1 228 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FAM217AQ8IXS0 508 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC36Q8IYA8 594 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PM20D2Q8IYS1 436 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF679Q8IYX0 411 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CLEC4FQ8N1N0 589 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CRYBG2Q8N1P7 616 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NATD1Q8N6N6 113 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MB21D1Q8N884 522 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SPATA4Q8NEY3 305 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 AKR7LQ8NHP1 331 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CAPSLQ8WWF8 208 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ST8SIA2Q92186 375 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 JADE3Q92613 823 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PIGKQ92643 395 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PHKBQ93100 1093 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FBXO32Q969P5 355 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MASTLQ96GX5 879 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TPD52L3Q96J77 140 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TEKT5Q96M29 485 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 COQ10AQ96MF6 247 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 BBS4Q96RK4 519 aa3.07□□□□□ -1.92
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