RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570051.5

RNPS1-226, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 735 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-226ENST00000570051 CTSEP14091 401 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 BPIP17213 487 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 CKMT2P17540 419 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 HMGCLP35914 325 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 SHC2P98077 582 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 SNX1Q13596 522 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 TCEA2Q15560 299 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 CCNG2Q16589 344 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 ALS2CLQ60I27 953 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 KCTD11Q693B1 232 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 TRIM74Q86UV6 250 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 MAIP1Q8WWC4 291 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 APOLD1Q96LR9 279 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 RAD18Q9NS91 495 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 MOSPD1Q9UJG1 213 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20.54■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 USP27XA6NNY8 438 aa20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 FUCA1P04066 466 aa20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 ACP1P24666 158 aa20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 DOK6Q6PKX4 331 aa20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 TRAM1L1Q8N609 369 aa20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 TMEM168Q9H0V1 697 aa20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 PYCARDQ9ULZ3 195 aa20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 U3KQA8 63 aa20.53■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 KIF5CO60282 957 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 USP12O75317 370 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 RFPL3O75679 317 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 IVLP07476 585 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 CKMT1AP12532 417 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 POLD2P49005 469 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 DAB2P98082 770 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 SPARCL1Q14515 664 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 CCDC157Q569K6 752 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 GKN2Q86XP6 184 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 BOCQ9BWV1 1114 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 SPATA16Q9BXB7 569 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 BPIFA1Q9NP55 256 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 IL17CQ9P0M4 197 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 SUFUQ9UMX1 484 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 CHD8Q9HCK8 2581 aa20.52■□□□□ 0.88
RNPS1-226ENST00000570051 IFNB1P01574 187 aa20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 MYF5P13349 255 aa20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 SPINK2P20155 84 aa20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 LVRNQ6Q4G3 990 aa20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 LRRC45Q96CN5 670 aa20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 PBKQ96KB5 322 aa20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 SCNM1Q9BWG6 230 aa20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 LRRC40Q9H9A6 602 aa20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 VPS18Q9P253 973 aa20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 DOLKQ9UPQ8 538 aa20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 PTPRBP23467 1997 aa20.51■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 AP2A1O95782 977 aa20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 GNPDA1P46926 289 aa20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 ILKQ13418 452 aa20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 DHRS13Q6UX07 377 aa20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 PRUNE1Q86TP1 453 aa20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 SLC35F3Q8IY50 421 aa20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 CCL4L1Q8NHW4 92 aa20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 ARL5AQ9Y689 179 aa20.5■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 MYLKQ15746 1914 aa20.49■□□□□ 0.87
RNPS1-226ENST00000570051 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms