RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563951.1

CCDC33-211, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC33, Length 308 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-211ENST00000563951 LMX1AQ8TE12 382 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 C1orf54Q8WWF1 131 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 CDC6Q99741 560 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 APOL2Q9BQE5 337 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM121Q9BTD3 319 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 ADGRE3Q9BY15 652 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 MAGEE1Q9HCI5 957 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 NLGN3Q9NZ94 848 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 KLQ9UEF7 1012 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 KLK13Q9UKR3 277 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 DGKBQ9Y6T7 804 aa8.49□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 PRSS38A1L453 326 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 GOLGA6CA6NDK9 693 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 LMO7DNF2Z398 122 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 H3BM21 787 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 HAX1O00165 279 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 TNFRSF10CO14798 259 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 INPP4BO15327 924 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 GPR39O43194 453 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 USP12O75317 370 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 RASGRP1O95267 797 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 EPOP01588 193 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 FGF1P05230 155 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 GOLGA6DP0CG33 693 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 ETS1P14921 441 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 HLA-DPA1P20036 260 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 NFKBIAP25963 317 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 CXCR5P32302 372 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 CETN2P41208 172 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 GPR1P46091 355 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 GEMP55040 296 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 SPARCL1Q14515 664 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 PTPRCAPQ14761 206 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 ALS2CLQ60I27 953 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 DOK6Q6PKX4 331 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 RANBP10Q6VN20 620 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 NLRP8Q86W28 1048 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 NRROSQ86YC3 692 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 SLC35F3Q8IY50 421 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 NDUFAF2Q8N183 169 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 SLC35F6Q8N357 371 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 FAM181AQ8N9Y4 354 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 KYQ8NBH2 561 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 APOLD1Q96LR9 279 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 BOCQ9BWV1 1114 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM168Q9H0V1 697 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 SPASTQ9UBP0 616 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 SUFUQ9UMX1 484 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa8.48□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 TPP1O14773 563 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 YY2O15391 372 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 BUD23O43709 281 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 CEP104O60308 925 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 DNAJC6O75061 913 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 RFPL3O75679 317 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 ANXA9O76027 345 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 FGGP02679 453 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 CKMT1AP12532 417 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 ACP1P24666 158 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 HTR1BP28222 390 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 HMGCLP35914 325 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 FOXK2Q01167 660 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 SNX1Q13596 522 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 GUSBP11Q6P575 273 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 DHRS13Q6UX07 377 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 PRELID2Q8N945 189 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 COG1Q8WTW3 980 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 BTN2A2Q8WVV5 523 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 SLC39A7Q92504 469 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 SCNM1Q9BWG6 230 aa8.47□□□□□ -1.05
CCDC33-211ENST00000563951 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms