RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 REEP2Q9BRK0 252 aa3.23□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 NUF2Q9BZD4 464 aa3.23□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 MAGEE1Q9HCI5 957 aa3.23□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 FAM118AQ9NWS6 357 aa3.23□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 PNPLA6Q8IY17 1366 aa3.23□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 NRKQ7Z2Y5 1582 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 PTCH1Q13635 1447 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 MIA2Q96PC5 1412 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 TMEM202A6NGA9 273 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 TEX22C9J3V5 150 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 GUCY1B2O75343 617 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 HEXAP06865 529 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 FGF5P12034 268 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 HSD17B4P51659 736 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 EFNB1P98172 346 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 SREBF2Q12772 1141 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 TAF5Q15542 800 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 PDSS1Q5T2R2 415 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 ANKRD54Q6NXT1 300 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 SLC36A4Q6YBV0 504 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 BBS12Q6ZW61 710 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 NOXA1Q86UR1 476 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 C1orf87Q8N0U7 546 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 SLC24A4Q8NFF2 622 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 BBS10Q8TAM1 723 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 SLC20A1Q8WUM9 679 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 CCT6BQ92526 530 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 BBS4Q96RK4 519 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 SYT17Q9BSW7 474 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 CSTL1Q9H114 145 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 BPIFA1Q9NP55 256 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 PADI1Q9ULC6 663 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 FAM96BQ9Y3D0 163 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 DLC1Q96QB1 1528 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 PARD3Q8TEW0 1356 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 MROH1Q8NDA8 1641 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 PZPP20742 1482 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 WDR90Q96KV7 1748 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3-204ENST00000561685 ATP10DQ9P241 1426 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 GAGE10A6NGK3 116 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 DVL1O14640 695 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 IRF1P10914 325 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 PAX1P15863 534 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 TAF6P49848 677 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 MMP14P50281 582 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 GRIK3Q13003 919 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 GAGE5Q13069 117 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 GAGE6Q13070 117 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 SLC12A1Q13621 1099 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 KRT71Q3SY84 523 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 SGO1Q5FBB7 561 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 ZNF667Q5HYK9 610 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 SLC35F3Q8IY50 421 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 SPATA5Q8NB90 893 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 RUFY2Q8WXA3 655 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 RND1Q92730 232 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 C17orf77Q96MU5 243 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 ZNF583Q96ND8 569 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 F2RL3Q96RI0 385 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 GFRA4Q9GZZ7 299 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 TMEM160Q9NX00 188 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 HCN3Q9P1Z3 774 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 GLI3P10071 1580 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 MAST1Q9Y2H9 1570 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 MYOM1P52179 1685 aa3.2□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa3.2□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 MYO5CQ9NQX4 1742 aa3.2□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 TAF4O00268 1085 aa3.2□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 WDR1O75083 606 aa3.2□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 INHBAP08476 426 aa3.2□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 G6PDP11413 515 aa3.2□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 KRT5P13647 590 aa3.2□□□□□ -1.9
RRN3-204ENST00000561685 ITGA2P17301 1181 aa3.2□□□□□ -1.9
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