RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	VOPP1	Q96AW1	172 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	SPACA7	Q96KW9	195 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ACOX2	Q99424	681 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	OMD	Q99983	421 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	KIFC1	Q9BW19	673 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	CEP41	Q9BYV8	373 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	FOXQ1	Q9C009	403 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PPCS	Q9HAB8	311 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	SNX24	Q9Y343	169 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PKP3	Q9Y446	797 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PLXNA2	O75051	1894 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	USP34	Q70CQ2	3546 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	MROH6	A6NGR9	719 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PRR19	A6NJB7	356 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PRR33	A8MZF0	331 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PFDN6	O15212	129 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM63A	O94886	807 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PIGN	O95427	931 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ABHD2	P08910	425 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	GABRG2	P18507	467 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PGAM1	P18669	254 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	TEAD1	P28347	426 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ECHS1	P30084	290 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	VIPR1	P32241	457 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PHB	P35232	272 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	SOX18	P35713	384 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	MMP12	P39900	470 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	SLC7A5	Q01650	507 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ACVR1	Q04771	509 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	DPT	Q07507	201 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	MTAP	Q13126	283 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	NAB1	Q13506	487 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	AGBL4	Q5VU57	503 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF534	Q76KX8	674 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	DPPA4	Q7L190	304 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	GALNT7	Q86SF2	657 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	CROCCP2	Q86T23	111 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM135	Q86UB9	458 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	TRIM69	Q86WT6	500 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	MPP5	Q8N3R9	675 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	FBXL6	Q8N531	539 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	MREG	Q8N565	214 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PAF1	Q8N7H5	531 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	CHST14	Q8NCH0	376 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	CALML6	Q8TD86	181 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	STYX	Q8WUJ0	223 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	CAVIN3	Q969G5	261 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CHP1-208	ENST00000560965	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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