RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 HIC2Q96JB3 615 aa20.81■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 APOL2Q9BQE5 337 aa20.81■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 SCNM1Q9BWG6 230 aa20.81■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 CDH19Q9H159 772 aa20.81■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 TRABDQ9H4I3 376 aa20.81■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 RAD18Q9NS91 495 aa20.81■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 HACD3Q9P035 362 aa20.81■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 DOLKQ9UPQ8 538 aa20.81■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa20.81■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 U3KQA8 63 aa20.81■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 CEP104O60308 925 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 METTL18O95568 372 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 FGGP02679 453 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 FUCA1P04066 466 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 CKMT1AP12532 417 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 BPIP17213 487 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 ACP1P24666 158 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 HMGCLP35914 325 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 SNX1Q13596 522 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 GSE1Q14687 1217 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 PARP6Q2NL67 630 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 DHRS13Q6UX07 377 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 RANBP10Q6VN20 620 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 COX14Q96I36 57 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM168Q9H0V1 697 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 BPIFA1Q9NP55 256 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 KLK13Q9UKR3 277 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 SUFUQ9UMX1 484 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.8■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 USP12O75317 370 aa20.79■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 IVLP07476 585 aa20.79■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 STIP1P31948 543 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 GNPDA1P46926 289 aa20.79■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 SPARCL1Q14515 664 aa20.79■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.79■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 GKN2Q86XP6 184 aa20.79■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa20.79■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.79■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 BOCQ9BWV1 1114 aa20.79■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 SPATA16Q9BXB7 569 aa20.79■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 ILKQ13418 452 aa20.78■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 P3H1Q32P28 736 aa20.78■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 KCTD11Q693B1 232 aa20.78■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 LVRNQ6Q4G3 990 aa20.78■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 TAF8Q7Z7C8 310 aa20.78■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 SLC35F3Q8IY50 421 aa20.78■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 TRAM1L1Q8N609 369 aa20.78■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 CCL4L1Q8NHW4 92 aa20.78■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa20.78■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.78■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 IFNB1P01574 187 aa20.77■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 NR0B2Q15466 257 aa20.77■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 CCNG2Q16589 344 aa20.77■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.77■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.77■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 SLC35F6Q8N357 371 aa20.77■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 MAIP1Q8WWC4 291 aa20.77■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa20.77■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.77■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 IL17CQ9P0M4 197 aa20.77■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 SIRPGQ9P1W8 387 aa20.77■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 GPR34Q9UPC5 381 aa20.77■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.77■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa20.77■□□□□ 0.92
TMOD3-203ENST00000558455 CHD8Q9HCK8 2581 aa20.76■□□□□ 0.91
TMOD3-203ENST00000558455 USP27XA6NNY8 438 aa20.76■□□□□ 0.91
TMOD3-203ENST00000558455 KIF5CO60282 957 aa20.76■□□□□ 0.91
TMOD3-203ENST00000558455 ASMTLO95671 621 aa20.76■□□□□ 0.91
TMOD3-203ENST00000558455 CDK4P11802 303 aa20.76■□□□□ 0.91
TMOD3-203ENST00000558455 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.76■□□□□ 0.91
TMOD3-203ENST00000558455 GUSBP11Q6P575 273 aa20.76■□□□□ 0.91
TMOD3-203ENST00000558455 PRUNE1Q86TP1 453 aa20.76■□□□□ 0.91
TMOD3-203ENST00000558455 ARL10Q8N8L6 244 aa20.76■□□□□ 0.91
TMOD3-203ENST00000558455 KYQ8NBH2 561 aa20.76■□□□□ 0.91
TMOD3-203ENST00000558455 GPBAR1Q8TDU6 330 aa20.76■□□□□ 0.91
TMOD3-203ENST00000558455 GLMNQ92990 594 aa20.76■□□□□ 0.91
TMOD3-203ENST00000558455 LRRC45Q96CN5 670 aa20.76■□□□□ 0.91
TMOD3-203ENST00000558455 OR2M4Q96R27 311 aa20.76■□□□□ 0.91
TMOD3-203ENST00000558455 LRRC40Q9H9A6 602 aa20.76■□□□□ 0.91
TMOD3-203ENST00000558455 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
TMOD3-203ENST00000558455 VPS18Q9P253 973 aa20.76■□□□□ 0.91
TMOD3-203ENST00000558455 ARL5AQ9Y689 179 aa20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms