RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 NDUFA10O95299 355 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PDGFAP04085 211 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 FURINP09958 794 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 IL10RBQ08334 325 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 DNASE1L3Q13609 305 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 KIR2DS5Q14953 304 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 USP45Q70EL2 814 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 SLC34A3Q8N130 599 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 NDUFAF2Q8N183 169 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 BBS5Q8N3I7 341 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 GALNT6Q8NCL4 622 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PSKH2Q96QS6 385 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 STK33Q9BYT3 514 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 SLC39A8Q9C0K1 460 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 SLAMF7Q9NQ25 335 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ACSS2Q9NR19 701 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 FHOD1Q9Y613 1164 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 WIPF3A6NGB9 483 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 DAPK3O43293 454 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 DPM1O60762 260 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 CALB1P05937 261 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 RNF224P0DH78 156 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 NSFP46459 744 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 CDR2Q01850 454 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ZNF235Q14590 738 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 CHRNA6Q15825 494 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 NADK2Q4G0N4 442 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 IYDQ6PHW0 289 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 Q6ZVL8 140 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 NLRP8Q86W28 1048 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 C3orf20Q8ND61 904 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PRR7Q8TB68 274 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 AP2M1Q96CW1 435 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 SCRN2Q96FV2 425 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 C9orf72Q96LT7 481 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ZNF599Q96NL3 588 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 OR6C1Q96RD1 312 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 NDST4Q9H3R1 872 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 VPS18Q9P253 973 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 CACNA1DQ01668 2161 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 SIGLEC16A6NMB1 481 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 TCP11X1B4DZS4 312 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 F8VZ95 297 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 CCP110O43303 1012 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 DNAJB5O75953 348 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ASMTLO95671 621 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 C9P02748 559 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 F3P13726 295 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 UCHL3P15374 230 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ZNF28P17035 718 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 COL8A1P27658 744 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 LBRQ14739 615 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 UGT8Q16880 541 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 VWA3BQ502W6 1294 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 RALGPS1Q5JS13 557 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 WDR59Q6PJI9 974 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ZNF765Q7L2R6 523 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 TMEM135Q86UB9 458 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 PPP1R3BQ86XI6 285 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 EXD1Q8NHP7 514 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 C5orf34Q96MH7 638 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 GPR87Q9BY21 358 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 RMI1Q9H9A7 625 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 UCK1Q9HA47 277 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 MLXIPLQ9NP71 852 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 LHX9Q9NQ69 397 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ADAM22Q9P0K1 906 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 KIAA1468Q9P260 1216 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 MAP10Q9P2G4 905 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-228ENST00000551473 DNPEPQ9ULA0 475 aa11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms