RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 SIRPB2Q5JXA9 342 aa21.74■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa21.74■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa21.74■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa21.74■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 ZNF662Q6ZS27 426 aa21.74■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 ARL10Q8N8L6 244 aa21.74■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 KYQ8NBH2 561 aa21.74■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 TTC13Q8NBP0 860 aa21.74■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 GPR26Q8NDV2 337 aa21.74■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 CCL4L1Q8NHW4 92 aa21.74■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 GORASP1Q9BQQ3 440 aa21.74■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 SUFUQ9UMX1 484 aa21.74■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 CEP295Q9C0D2 2601 aa21.73■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa21.73■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 FADS2P1A8MWK0 482 aa21.73■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 IVLP07476 585 aa21.73■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 GEMP55040 296 aa21.73■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 CAMK2BQ13554 666 aa21.73■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 PERM1Q5SV97 790 aa21.73■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.73■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 COX14Q96I36 57 aa21.73■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 PADI4Q9UM07 663 aa21.73■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 SCN8AQ9UQD0 1980 aa21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 TMEM8BA6NDV4 472 aa21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 AURKAO14965 403 aa21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 NRDCO43847 1150 aa21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 ANXA9O76027 345 aa21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 PSMB4P28070 264 aa21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 SLC1A5Q15758 541 aa21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 ST3GAL2Q16842 350 aa21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 ALS2CLQ60I27 953 aa21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 FAM46DQ8NEK8 389 aa21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 CCDC110Q8TBZ0 833 aa21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 MAPK15Q8TD08 544 aa21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 GPBAR1Q8TDU6 330 aa21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 NAT6Q93015 286 aa21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 SPATA13Q96N96 652 aa21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 FSD1LQ9BXM9 530 aa21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 RAD18Q9NS91 495 aa21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 ASXL3Q9C0F0 2248 aa21.72■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 AGTP01019 485 aa21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 HLA-DPA1P20036 260 aa21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 DCDC1P59894 354 aa21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 SEL1L2Q5TEA6 688 aa21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 MEI1Q5TIA1 1274 aa21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 NRROSQ86YC3 692 aa21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 SLC35B2Q8TB61 432 aa21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 FICDQ9BVA6 458 aa21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 SPATA16Q9BXB7 569 aa21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 GSDMCQ9BYG8 508 aa21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 CDH19Q9H159 772 aa21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 ABCG4Q9H172 646 aa21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 CLCA2Q9UQC9 943 aa21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PUS1-211ENST00000544662 TRABD2BA6NFA1 517 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ASMTLO95671 621 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 MT-CO3P00414 261 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 FGF1P05230 155 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 BPIP17213 487 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ADCY8P40145 1251 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 CTBSQ01459 385 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 PRPSAP1Q14558 356 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 RPS6KA1Q15418 735 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 CDCP2Q5VXM1 449 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 OGFOD3Q6PK18 319 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 TTC30BQ8N4P2 665 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 GPR156Q8NFN8 814 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ALS2CR12Q96Q35 445 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 OR2M4Q96R27 311 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 DPEP2Q9H4A9 486 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 TRABDQ9H4I3 376 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 BPIFA1Q9NP55 256 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 GPSM3Q9Y4H4 160 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 RP1P56715 2156 aa21.7■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 C5orf60A6NFR6 353 aa21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 B4DGG1 531 aa21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 NOBOXO60393 691 aa21.69■■□□□ 1.06
PUS1-211ENST00000544662 AK4P27144 223 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms