RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa21.84■■□□□ 1.09
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PTPRK-222ENST00000532751 INPP4BO15327 924 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRK-222ENST00000532751 IFNB1P01574 187 aa21.83■■□□□ 1.09
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PTPRK-222ENST00000532751 CDK4P11802 303 aa21.83■■□□□ 1.09
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PTPRK-222ENST00000532751 FDFT1P37268 417 aa21.82■■□□□ 1.08
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PTPRK-222ENST00000532751 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRK-222ENST00000532751 APOL2Q9BQE5 337 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRK-222ENST00000532751 BPIFA1Q9NP55 256 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRK-222ENST00000532751 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
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PTPRK-222ENST00000532751 ACP1P24666 158 aa21.81■■□□□ 1.08
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PTPRK-222ENST00000532751 SPARCL1Q14515 664 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRK-222ENST00000532751 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa21.81■■□□□ 1.08
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PTPRK-222ENST00000532751 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
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PTPRK-222ENST00000532751 VPS18Q9P253 973 aa21.8■■□□□ 1.08
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PTPRK-222ENST00000532751 LPOP22079 712 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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PTPRK-222ENST00000532751 PDE1BQ01064 536 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRK-222ENST00000532751 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
PTPRK-222ENST00000532751 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PTPRK-222ENST00000532751 LINC00523Q86TU6 105 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRK-222ENST00000532751 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRK-222ENST00000532751 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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