RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524349.5

RPS20-211, Transcript of ribosomal protein S20, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS20, Length 752 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS20-211ENST00000524349 CCDC66A2RUB6 948 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 NOBOXO60393 691 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 BRINP1O60477 761 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 FTCDO95954 541 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 APOC2P02655 101 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 PYGMP11217 842 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 RBL1P28749 1068 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 ADCY8P40145 1251 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 WNT3AP56704 352 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 COPS2P61201 443 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 KIF5AQ12840 1032 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 SLC25A41Q8N5S1 370 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 GPR156Q8NFN8 814 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 ACTL9Q8TC94 416 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 GPBAR1Q8TDU6 330 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 GSDMCQ9BYG8 508 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 GPR63Q9BZJ6 419 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 ARFGAP3Q9NP61 516 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 TAAR2Q9P1P5 351 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 DKK4Q9UBT3 224 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 FAM153AQ9UHL3 310 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 SPO11Q9Y5K1 396 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 ST14Q9Y5Y6 855 aa25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
RPS20-211ENST00000524349 AURKAO14965 403 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 MTSS1O43312 755 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 NDST3O95803 873 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 IVLP07476 585 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 CHRNA4P43681 627 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 MAZP56270 477 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 CCL7P80098 99 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 CTBSQ01459 385 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 RTP5Q14D33 572 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 ISXQ2M1V0 245 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 CCDC70Q6NSX1 233 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 KDELC1Q6UW63 502 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 PEX26Q7Z412 305 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 OR2M4Q96R27 311 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 RSPH14Q9UHP6 348 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 AMFRQ9UKV5 643 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 RNF215Q9Y6U7 377 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa25.13■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 HACD1B0YJ81 288 aa25.12■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 SPIDRQ14159 915 aa25.12■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 C14orf28Q4W4Y0 310 aa25.12■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 OGFOD3Q6PK18 319 aa25.12■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 NLRP8Q86W28 1048 aa25.12■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 GPR26Q8NDV2 337 aa25.12■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 IPMKQ8NFU5 416 aa25.12■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa25.12■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 PATE1Q8WXA2 126 aa25.12■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 COX14Q96I36 57 aa25.12■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 SPATA16Q9BXB7 569 aa25.12■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 MAGEE1Q9HCI5 957 aa25.12■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 APC2O95996 2303 aa25.11■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 KNTC1P50748 2209 aa25.11■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.11■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 FGF1P05230 155 aa25.11■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 PYGLP06737 847 aa25.11■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 ACTR1BP42025 376 aa25.11■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 ACTR1AP61163 376 aa25.11■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 GABREP78334 506 aa25.11■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 SLC14A2Q15849 920 aa25.11■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 GALNT13Q8IUC8 556 aa25.11■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 CDH19Q9H159 772 aa25.11■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 BPIFA1Q9NP55 256 aa25.11■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 LRIT1Q9P2V4 623 aa25.11■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa25.11■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 ASXL3Q9C0F0 2248 aa25.1■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 MYLKQ15746 1914 aa25.1■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 PMS2P1A4D2B8 440 aa25.1■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 AGRPO00253 132 aa25.1■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 PTMAP06454 111 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 XRCC4Q13426 336 aa25.1■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.613e-7■■□□□ 11.9
RPS20-211ENST00000524349 PYCR3Q53H96 274 aa25.1■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 C3orf38Q5JPI3 329 aa25.1■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 SIRPB2Q5JXA9 342 aa25.1■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 CERCAMQ5T4B2 595 aa25.1■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 FOXR1Q6PIV2 292 aa25.1■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 TMC3Q7Z5M5 1100 aa25.1■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 MRGPRX2Q96LB1 330 aa25.1■■□□□ 1.61
RPS20-211ENST00000524349 FCRL5Q96RD9 977 aa25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms