RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516876.1

RNU6-928P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 928, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-928P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 SYCE3A1L190 88 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 PIPSLA2A3N6 862 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 CPED1A4D0V7 1026 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 PATE3B3GLJ2 98 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM86B1E9PN63 330 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF623O75123 536 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 CRCPO75575 148 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 CAMTA2O94983 1202 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 NDUFB4O95168 129 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 GCNT3O95395 438 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 GUCA1CO95843 209 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 BCL10O95999 233 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 TFPIP10646 304 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRLRP16471 622 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 FPR3P25089 353 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 SHMT1P34896 483 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 PTGS2P35354 604 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 CD86P42081 329 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 CCT8P50990 548 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF81P51508 661 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 CLCN3P51790 818 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 STARD6P59095 220 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 HTD2P86397 168 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 GRIK2Q13002 908 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 MTA1Q13330 715 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 NEDD9Q14511 834 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARHGEF6Q15052 776 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 PGM5Q15124 567 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 PKN1Q16512 942 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 UGCGQ16739 394 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 CDO1Q16878 200 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 CDONQ4KMG0 1287 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 CEP85Q6P2H3 762 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 CASC4Q6P4E1 433 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 Q6ZSN1 163 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 AACSQ86V21 672 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 DENND6AQ8IWF6 608 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMEM217Q8N7C4 229 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 SCCPDHQ8NBX0 429 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 MCPH1Q8NEM0 835 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 RASSF8Q8NHQ8 419 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 TFAP2BQ92481 460 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC9A6Q92581 669 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 CDCA5Q96FF9 252 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 RUFY1Q96T51 708 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 SEPHS2Q99611 448 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 SH3GL2Q99962 352 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 ADAM2Q99965 735 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 NYXQ9GZU5 481 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC28A3Q9HAS3 691 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 TUFT1Q9NNX1 390 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZFP64Q9NPA5 681 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 RNF146Q9NTX7 359 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMEM161AQ9NX61 479 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 ANKRD10Q9NXR5 420 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 SEPT10Q9P0V9 454 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 HMG20BQ9P0W2 317 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 ACTR3BQ9P1U1 418 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 DKK2Q9UBU2 259 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 NDRG3Q9UGV2 375 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 APPL1Q9UKG1 709 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 FBXO4Q9UKT5 387 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 STX8Q9UNK0 236 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 FZD1Q9UP38 647 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 ITM2BQ9Y287 266 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 KCNK7Q9Y2U2 307 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 KIF3AQ9Y496 699 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 TCAF1Q9Y4C2 921 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 TRIM17Q9Y577 477 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 WNT6Q9Y6F9 365 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-928P-201ENST00000516876 A0A1W2PR77 199 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-928P-201ENST00000516876 HSPB2A8KAH6 182 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-928P-201ENST00000516876 YDJCA8MPS7 323 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-928P-201ENST00000516876 VWC2LB2RUY7 222 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-928P-201ENST00000516876 H3BQ06 376 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-928P-201ENST00000516876 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-928P-201ENST00000516876 ATP2C2O75185 946 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLCO2B1O94956 709 aa3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms