RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516042.1

RNU6-772P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 772, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-772P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 MSH3P20585 1137 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 BDKRB2P30411 391 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 RYKP34925 604 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 RAD23BP54727 409 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 MBTD1Q05BQ5 628 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 C2orf83Q53S99 150 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 ISCA2Q86U28 154 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 TXLNBQ8N3L3 684 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 MIPOL1Q8TD10 442 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZFAND2BQ8WV99 257 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 SNAPC3Q92966 411 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 MAGED4Q96JG8 741 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 GAL3ST4Q96RP7 486 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 APOL5Q9BWW9 433 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 P2RY12Q9H244 342 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 THAP1Q9NVV9 213 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 IKZF3Q9UKT9 509 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 CNPY2Q9Y2B0 182 aa0.71□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 FLT1P17948 1338 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 PLOD2O00469 737 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 KPNA5O15131 536 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 NCAM2O15394 837 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 DNPH1O43598 174 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 METTL18O95568 372 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 PCNAP12004 261 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF19P17023 458 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 MCCP23508 829 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 IL4RP24394 825 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 CDK7P50613 346 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 GSCP56915 257 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 SP3Q02447 781 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 ITGADQ13349 1161 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 NFATC2Q13469 925 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 ACVR2BQ13705 512 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 RAB30Q15771 203 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 MTSS1LQ765P7 747 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 CHD1LQ86WJ1 897 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 SUMF1Q8NBK3 374 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 TMEM178AQ8NBL3 297 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 DNAAF1Q8NEP3 725 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 TYMSOSQ8TAI1 123 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 GDPD5Q8WTR4 605 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 NCSTNQ92542 709 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 SEMA4DQ92854 862 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 TOMM40LQ969M1 308 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 RTP3Q9BQQ7 232 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 CHRDL1Q9BU40 450 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 CLEC7AQ9BXN2 247 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 WWTR1Q9GZV5 400 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 CDH19Q9H159 772 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 HDAC6Q9UBN7 1215 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 BAG5Q9UL15 447 aa0.7□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 CBY3A6NI87 242 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 EFCAB8A8MWE9 144 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 KLRF2D3W0D1 207 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 HAT1O14929 419 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 IDH3BO43837 385 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 GPRIN2O60269 458 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 NXPH2O95156 264 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 CLDN1O95832 211 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 CYC1P08574 325 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 ACP5P13686 325 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 CHN1P15882 459 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 DDX5P17844 614 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 BCL3P20749 454 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 ELF1P32519 619 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 DDIT3P35638 169 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 STT3AP46977 705 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 MVDP53602 400 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 HUNKP57058 714 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 MCL1Q07820 350 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 DRP2Q13474 957 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC35G1Q2M3R5 365 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 WSCD1Q658N2 575 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 ANKRD54Q6NXT1 300 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 GJB7Q6PEY0 223 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-772P-201ENST00000516042 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms