RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 POM121BA6NF01 834 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 NEMP2A6NFY4 417 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 NEMP1O14524 444 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 RAD51BO15315 384 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 SOCS5O75159 536 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 MMP2P08253 660 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 CKMT1AP12532 417 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ITGA8P53708 1063 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 TERF1P54274 439 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 WNT3AP56704 352 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 CDK18Q07002 472 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 SGCGQ13326 291 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 FGL2Q14314 439 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 KCNJ11Q14654 390 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 FAM182AQ5T1J6 154 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 CFAP58Q5T655 872 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 KCTD11Q693B1 232 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 KDELC1Q6UW63 502 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 GDPD4Q6W3E5 623 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 MCUQ8NE86 351 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 IPMKQ8NFU5 416 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 OR6K2Q8NGY2 324 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 FAM174AQ8TBP5 190 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 HCAR2Q8TDS4 363 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 IFT81Q8WYA0 676 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ART4Q93070 314 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 TADA1Q96BN2 335 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 BMFQ96LC9 184 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 TBL1YQ9BQ87 522 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ADGRE3Q9BY15 652 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 FOXP3Q9BZS1 431 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 TSPYL1Q9H0U9 437 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 ABCG4Q9H172 646 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 SUV39H2Q9H5I1 410 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 NLGN3Q9NZ94 848 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 SHOC2Q9UQ13 582 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 FADS3Q9Y5Q0 445 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 BAHCC1Q9P281 2608 aa11.34□□□□□ -0.59
UBE2B-208ENST00000511807 IGLON5A6NGN9 336 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 K7ESM1 405 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 FPGTO14772 594 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SCAMP1O15126 338 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 OPA1O60313 960 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SUN1O94901 812 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PRB1P04280 392 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 MPOP05164 745 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 GIMD1P0DJR0 217 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 NFKBIAP25963 317 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 GKP32189 559 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 EPHB1P54762 984 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PLTPP55058 493 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 RPL26P61254 145 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 FZD2Q14332 565 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PCSK7Q16549 785 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TBC1D25Q3MII6 688 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ARMC12Q5T9G4 340 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CEP128Q6ZU80 1094 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 CAMK1DQ8IU85 385 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 NAT8LQ8N9F0 302 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 MYRIPQ8NFW9 859 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 SLC39A7Q92504 469 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 MRGPRX2Q96LB1 330 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 DEPDC7Q96QD5 511 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 GORASP1Q9BQQ3 440 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 FICDQ9BVA6 458 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PRORYQ9H606 182 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 GRHL1Q9NZI5 618 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 ITM2BQ9Y287 266 aa11.33□□□□□ -0.6
UBE2B-208ENST00000511807 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms