RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 VPS37BQ9H9H4 285 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 HELLSQ9NRZ9 838 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TXLNGQ9NUQ3 528 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 HPF1Q9NWY4 346 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 MIS18AQ9NYP9 233 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 MTRRQ9UBK8 725 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 GPR52Q9Y2T5 361 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ZHX2Q9Y6X8 837 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TENM4Q6N022 2769 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 IGSF10Q6WRI0 2623 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 DOCK2Q92608 1830 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 A0A1B0GUL6 1792 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 A0A087WZ62 844 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 FAM90A10PA6NDY2 464 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TSPY2A6NKD2 308 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 C2CD4BA6NLJ0 364 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ENO4A6NNW6 628 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 AP3B1O00203 1094 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SOCS5O75159 536 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SLITRK3O94933 977 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 WDR47O94967 919 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CSPG5O95196 566 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 EPN2O95208 641 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PLAUP00749 431 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PYGLP06737 847 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TSPY3P0CV98 308 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TSPY8P0CW00 308 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 HSD3B1P14060 373 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 AVPR2P30518 371 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 MAPK4P31152 587 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 MNAT1P51948 309 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 JAK3P52333 1124 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SLC12A2P55011 1212 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 B2MP61769 119 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 WDR5P61964 334 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CCNA1P78396 465 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 HSF1Q00613 529 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TSPY1Q01534 308 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 BNIP1Q12981 228 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SEMA5AQ13591 1074 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CLCA4Q14CN2 919 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ACOX1Q15067 660 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 KRTCAP3Q53RY4 240 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 LIN54Q6MZP7 749 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 XRRA1Q6P2D8 792 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 MFSD6Q6ZSS7 791 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 RNF44Q7L0R7 432 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TAOK1Q7L7X3 1001 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 GPR142Q7Z601 462 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SPATA24Q86W54 205 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 LSMEM2Q8N112 164 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 OR6C4Q8NGE1 309 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 FBXO30Q8TB52 745 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TRPC4APQ8TEL6 797 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 DNAAF4Q8WXU2 420 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 KIF1BPQ96EK5 621 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 GIMAP5Q96F15 307 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 FAM227BQ96M60 508 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SIN3AQ96ST3 1273 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ADPGKQ9BRR6 497 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ISCA1Q9BUE6 129 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 NACAP1Q9BZK3 213 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 WNT5BQ9H1J7 359 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SLC25A32Q9H2D1 315 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CD209Q9NNX6 404 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ARL8BQ9NVJ2 186 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 OGFRQ9NZT2 677 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TBX21Q9UL17 535 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 HPCAL4Q9UM19 191 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CARD8Q9Y2G2 431 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SNX8Q9Y5X2 465 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 MYO9AB2RTY4 2548 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PTPN13Q12923 2485 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 A0A1B0GUL7 405 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SLC22A23A1A5C7 686 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TTC34A8MYJ7 566 aa3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms