RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 MYO5BQ9ULV0 1848 aa2.28□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa2.28□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 C17orf102A2RUQ5 167 aa2.28□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 MAGEB17A8MXT2 336 aa2.28□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 RNF103O00237 685 aa2.28□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 JRKO75564 520 aa2.28□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 C22orf31O95567 290 aa2.28□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 DDAH2O95865 285 aa2.28□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 INAQ16352 499 aa2.28□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 Q6ZRM9 215 aa2.28□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 TUSC5Q8IXB3 177 aa2.28□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 FAM118BQ9BPY3 351 aa2.28□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP2.27□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 F2RL1P55085 397 aa2.27□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 CBX3Q13185 183 aa2.27□□□□□ -2.05
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