RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ERC1Q8IUD2 1116 aa3.13□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DSELQ8IZU8 1212 aa3.13□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLD5Q8N7P1 536 aa3.13□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SH3GL2Q99962 352 aa3.13□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HAUS8Q9BT25 410 aa3.13□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MAGEE1Q9HCI5 957 aa3.13□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CNGB3Q9NQW8 809 aa3.13□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GPR52Q9Y2T5 361 aa3.13□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 STON1Q9Y6Q2 735 aa3.13□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 URODP06132 367 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HSD3B1P14060 373 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MAOAP21397 527 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RRM1P23921 792 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HALP42357 657 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GABRB2P47870 512 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CLCNKAP51800 687 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CDH15P55291 814 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMEM187Q14656 261 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NFIL3Q16649 462 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TXNDC8Q6A555 127 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRNP1Q6NT89 227 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ANKRD54Q6NXT1 300 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TAOK1Q7L7X3 1001 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RRM2BQ7LG56 351 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NOXA1Q86UR1 476 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 STPG4Q8N801 248 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRIM58Q8NG06 486 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ST6GAL2Q96JF0 529 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BBS4Q96RK4 519 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NUF2Q9BZD4 464 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PELI2Q9HAT8 420 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC52A3Q9NQ40 469 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C20orf141Q9NUB4 165 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMEM30AQ9NV96 361 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TINAGQ9UJW2 476 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RCOR1Q9UKL0 485 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HSF4Q9ULV5 492 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM96BQ9Y3D0 163 aa3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TMEM202A6NGA9 273 aa3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PIP5K1CO60331 668 aa3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TACC1O75410 805 aa3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TFP02787 698 aa3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EDN2P20800 178 aa3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 VAMP2P63027 116 aa3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TLE2Q04725 743 aa3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GRIK3Q13003 919 aa3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CAMK1Q14012 370 aa3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LRRTM4Q86VH4 590 aa3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CDC20BQ86Y33 519 aa3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CPOQ8IVL8 374 aa3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FOXRED2Q8IWF2 684 aa3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC35F3Q8IY50 421 aa3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MOCOSQ96EN8 888 aa3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 H2AFJQ9BTM1 129 aa3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BPIFA1Q9NP55 256 aa3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HSPB7Q9UBY9 170 aa3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C2CD2Q9Y426 696 aa3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HOXB5P09067 269 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SHMT1P34896 483 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DCTP40126 519 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EFNA5P52803 228 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RUNX1T1Q06455 604 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PEX6Q13608 980 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PPP2R5BQ15173 497 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF790Q6PG37 636 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC36A4Q6YBV0 504 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 WDR63Q8IWG1 891 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SLC20A1Q8WUM9 679 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RND1Q92730 232 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GCC1Q96CN9 775 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FUZQ9BT04 418 aa3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms