RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 DGKKQ5KSL6 1271 aa10.75□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 CAMK1DQ8IU85 385 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 CMTM8Q8IZV2 173 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 CCNYL1Q8N7R7 359 aa10.75□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 MYO19Q96H55 970 aa10.75□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa10.75□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0J9YYE9 177 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC189A1A4V9 331 aa10.74□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 RFPL2O75678 378 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 TRBC1P01850 177 aa10.74□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 SRCP12931 536 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 PKMP14618 531 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 CCND1P24385 295 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 HMGCLP35914 325 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 ATP6V0D1P61421 351 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 SULT2A1Q06520 285 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 KLF10Q13118 480 aa10.74□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 CFAP157Q5JU67 520 aa10.74□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 SEL1L3Q68CR1 1132 aa10.74□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 LYSMD1Q96S90 227 aa10.74□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 CHD9Q3L8U1 2897 aa10.74□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 RHOBTB1O94844 696 aa10.73□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 CYBBP04839 570 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP2-209ENST00000504450 JUNP05412 331 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 ALPIP09923 528 aa10.73□□□□□ -0.69
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SH3BP2-209ENST00000504450 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP10.73□□□□□ -0.69
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