RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491553.1

TBC1D1-212, Transcript of TBC1 domain family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene TBC1D1, Length 455 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D1-212ENST00000491553 NEU3Q9UQ49 428 aa6.53□□□□□ -1.36
TBC1D1-212ENST00000491553 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.53□□□□□ -1.36
TBC1D1-212ENST00000491553 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa6.53□□□□□ -1.36
TBC1D1-212ENST00000491553 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 KCNN4O15554 427 aa6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 BUB1O43683 1085 aa6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 STX10O60499 249 aa6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 CUTAO60888 179 aa6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 FAM155BO75949 473 aa6.52□□□□□ -1.37
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TBC1D1-212ENST00000491553 GLI1P08151 1106 aa6.52□□□□□ -1.37
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TBC1D1-212ENST00000491553 PRR20CP86479 221 aa6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 PRR20DP86480 221 aa6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 PRR20BP86481 221 aa6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 PRR20AP86496 221 aa6.52□□□□□ -1.37
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TBC1D1-212ENST00000491553 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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TBC1D1-212ENST00000491553 GRHL3Q8TE85 626 aa6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 CCDC120Q96HB5 630 aa6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 C1orf74Q96LT6 269 aa6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 COQ10AQ96MF6 247 aa6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 NT5C1BQ96P26 610 aa6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 OR2M4Q96R27 311 aa6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.52□□□□□ -1.37
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TBC1D1-212ENST00000491553 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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TBC1D1-212ENST00000491553 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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TBC1D1-212ENST00000491553 ADGRG1Q9Y653 693 aa6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 A0A0U1RQS6 177 aa6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 A0A1B0GUH1 482 aa6.51□□□□□ -1.37
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TBC1D1-212ENST00000491553 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 RASA4BC9J798 803 aa6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 FAM72CH0Y354 149 aa6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 RASA4O43374 803 aa6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 THAP12O43422 761 aa6.51□□□□□ -1.37
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TBC1D1-212ENST00000491553 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.51□□□□□ -1.37
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TBC1D1-212ENST00000491553 CAPN3P20807 821 aa6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 TNFAIP3P21580 790 aa6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 KIR3DL1P43629 444 aa6.51□□□□□ -1.37
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TBC1D1-212ENST00000491553 PPP1CAP62136 330 aa6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 RPS15P62841 145 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 TLE4Q04727 773 aa6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 DEUP1Q05D60 604 aa6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 RAD51Q06609 339 aa6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 GPS2Q13227 327 aa6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 MTA1Q13330 715 aa6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 PYCR3Q53H96 274 aa6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 FAM72AQ5TYM5 149 aa6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 MANEALQ5VSG8 457 aa6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 AFMIDQ63HM1 303 aa6.51□□□□□ -1.37
TBC1D1-212ENST00000491553 DENND2CQ68D51 928 aa6.51□□□□□ -1.37
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