RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486404.5

CHMP3-208, Transcript of charged multivesicular body protein 3, human

TSL 3

Gene CHMP3, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHMP3-208	ENST00000486404	ALS2CL	Q60I27	953 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	PEX26	Q7Z412	305 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	TEKT5	Q96M29	485 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	ZMYND15	Q9H091	742 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	UBP1	Q9NZI7	540 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	ADAMTS20	P59510	1910 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	SOD1	P00441	154 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	ACTN2	P35609	894 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	ACTR1B	P42025	376 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	ACTR1A	P61163	376 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	XRCC4	Q13426	336 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	RTP5	Q14D33	572 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	NOMO1	Q15155	1222 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	ISX	Q2M1V0	245 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	CCNJL	Q8IV13	435 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF567	Q8N184	647 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	IPMK	Q8NFU5	416 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	TRIB3	Q96RU7	358 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	AGAP2	Q99490	1192 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	AMFR	Q9UKV5	643 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404		D6RAR5	112 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	TAF4	O00268	1085 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	ZW10	O43264	779 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	NOBOX	O60393	691 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	TJP3	O95049	919 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	CAPNS1	P04632	268 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	MPO	P05164	745 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	GLB1	P16278	677 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	PTPN7	P35236	360 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	ADCY8	P40145	1251 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	WNT3A	P56704	352 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	GSDMD	P57764	484 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	DCDC1	P59894	354 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	CTBS	Q01459	385 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	WASHC5	Q12768	1159 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	LRP8	Q14114	963 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	PID1	Q7Z2X4	250 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	NLRP8	Q86W28	1048 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM139	Q8IV31	216 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	GPR156	Q8NFN8	814 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	ACTL9	Q8TC94	416 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	VPS18	Q9P253	973 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	ZZEF1	O43149	2961 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CHMP3-208	ENST00000486404	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36

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