RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484581.6

VPS13A-211, Transcript of vacuolar protein sorting 13 homolog A, humanhuman

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Gene VPS13A, Length 1,155 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-211ENST00000484581 MTA2O94776 668 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 GOSR1O95249 250 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 CLDN7O95471 211 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 TFPIP10646 304 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 DCTDP32321 178 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 MMP14P50281 582 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 SLMAPQ14BN4 828 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 ARHGEF6Q15052 776 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 PROSER3Q2NL68 480 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 ARMC4Q5T2S8 1044 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 MPP7Q5T2T1 576 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 PQLC2Q6ZP29 291 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 AMIGO2Q86SJ2 522 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 IQCHQ86VS3 1027 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 CARNMT1Q8N4J0 409 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 LRRC57Q8N9N7 239 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 OR8K5Q8NH50 307 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 TEKT4Q8WW24 435 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 MAP4K1Q92918 833 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF333Q96JL9 665 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 EGLN2Q96KS0 407 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 CDRT15Q96T59 188 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 ACOX2Q99424 681 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 NUP85Q9BW27 656 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 GPR88Q9GZN0 384 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 SPATC1LQ9H0A9 340 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 DNAJB4Q9UDY4 337 aa4.56□□□□□ -1.68
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VPS13A-211ENST00000484581 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 UTS2RQ9UKP6 389 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 KANSL1LA0AUZ9 987 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 H0YAE9 185 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 KIR2DS3K7RE56 304 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 VCYO14598 125 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 MAP2K7O14733 419 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 DIAPH2O60879 1101 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 TADA2AO75478 443 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 SLCO2B1O94956 709 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 FTCDO95954 541 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 CD58P19256 250 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 HNF4AP41235 474 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
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VPS13A-211ENST00000484581 SREBF2Q12772 1141 aa4.55□□□□□ -1.68
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VPS13A-211ENST00000484581 DLG2Q15700 870 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 SNAPC1Q16533 368 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF674Q2M3X9 581 aa4.55□□□□□ -1.68
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VPS13A-211ENST00000484581 CBWD3Q5JTY5 395 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 RAPH1Q70E73 1250 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 FAM57BQ71RH2 274 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 HAUS6Q7Z4H7 955 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 UNC45BQ8IWX7 931 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 IQUBQ8NA54 791 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 SCCPDHQ8NBX0 429 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 CAMKVQ8NCB2 501 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 GRK7Q8WTQ7 553 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 MR1Q95460 341 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 CDHR1Q96JP9 859 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF570Q96NI8 536 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 DACH2Q96NX9 599 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 PCGF1Q9BSM1 259 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 FAM129AQ9BZQ8 928 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 MAGIXQ9H6Y5 334 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 OLAHQ9NV23 265 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 HAO2Q9NYQ3 351 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 DNAJB9Q9UBS3 223 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa4.55□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 A0A0U1RQK1 487 aa4.54□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 ARHGEF37A1IGU5 675 aa4.54□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF320A2RRD8 509 aa4.54□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 WDR91A4D1P6 747 aa4.54□□□□□ -1.68
VPS13A-211ENST00000484581 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
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