RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM5Q9C035 493 aa8.04□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 CDH19Q9H159 772 aa8.04□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.04□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa8.04□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 ABHD10Q9NUJ1 306 aa8.04□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 KCTD5Q9NXV2 234 aa8.04□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 SHOC2Q9UQ13 582 aa8.04□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 SCN8AQ9UQD0 1980 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 CAPN8A6NHC0 703 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 PSMD11O00231 422 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 PMPCBO75439 489 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 FUCA1P04066 466 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 ITGA2BP08514 1039 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF30P17039 623 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 CES1P23141 567 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 ARSEP51690 589 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 PDX1P52945 283 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 PTSQ03393 145 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 VAC14Q08AM6 782 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 NFATC2Q13469 925 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 LY6DQ14210 128 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 TGIF1Q15583 401 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC181Q5TID7 509 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 VASH2Q86V25 355 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 ZFAND4Q86XD8 727 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 FAM129CQ86XR2 697 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 NRROSQ86YC3 692 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 VSTM4Q8IW00 320 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 NRSN1Q8IZ57 195 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 TEX26Q8N6G2 289 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 EXD1Q8NHP7 514 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 GDAP1Q8TB36 358 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 GPBAR1Q8TDU6 330 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 USP7Q93009 1102 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 HAUS1Q96CS2 278 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 RNF31Q96EP0 1072 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 RNF157Q96PX1 679 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 SLC38A3Q99624 504 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 CMKLR1Q99788 373 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 DPH1Q9BZG8 443 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 GPR63Q9BZJ6 419 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 KCNK4Q9NYG8 393 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 UBP1Q9NZI7 540 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 DTLQ9NZJ0 730 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 PKD2L2Q9NZM6 624 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 KLHL3Q9UH77 587 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 KCNK6Q9Y257 313 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.03□□□□□ -1.12
CTPS1-209ENST00000480420 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 MACROD2A1Z1Q3 448 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 B4GAT1O43505 415 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 PRAMEF10O60809 474 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 MFAP3LO75121 409 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 C1QL1O75973 258 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 CPNE6O95741 557 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 ACP5P13686 325 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 COMTP21964 271 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 ETV5P41161 510 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 MAGEA1P43355 309 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 STC1P52823 247 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 ZBTB17Q13105 803 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 PEX6Q13608 980 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 IHHQ14623 411 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 PDK1Q15118 436 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 QPCTQ16769 361 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 MANEAQ5SRI9 462 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 NT5DC3Q86UY8 548 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 RHOT1Q8IXI2 618 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 SLC25A41Q8N5S1 370 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 ARRDC2Q8TBH0 407 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 MAML1Q92585 1016 aa8.02□□□□□ -1.13
CTPS1-209ENST00000480420 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
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