RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471283.5

MUC1-218, Transcript of mucin 1, cell surface associated, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MUC1, Length 635 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1-218ENST00000471283 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MUC1-218ENST00000471283 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
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MUC1-218ENST00000471283 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.65□□□□□ -0.06
MUC1-218ENST00000471283 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MUC1-218ENST00000471283 PRKAB1Q9Y478 270 aa14.65□□□□□ -0.06
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MUC1-218ENST00000471283 MATN3O15232 486 aa14.64□□□□□ -0.07
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MUC1-218ENST00000471283 TAS2R40P59535 323 aa14.64□□□□□ -0.07
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MUC1-218ENST00000471283 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.64□□□□□ -0.07
MUC1-218ENST00000471283 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.64□□□□□ -0.07
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MUC1-218ENST00000471283 B3GNT4Q9C0J1 378 aa14.64□□□□□ -0.07
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MUC1-218ENST00000471283 NENFQ9UMX5 172 aa14.64□□□□□ -0.07
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MUC1-218ENST00000471283 WISP1O95388 367 aa14.61□□□□□ -0.07
MUC1-218ENST00000471283 ZBED6P86452 979 aa14.61□□□□□ -0.07
MUC1-218ENST00000471283 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
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MUC1-218ENST00000471283 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MUC1-218ENST00000471283 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.61□□□□□ -0.07
MUC1-218ENST00000471283 CNTD1Q8N815 330 aa14.61□□□□□ -0.07
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