RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469856.1

ABCC10-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 10, human

TSL 3

Gene ABCC10, Length 285 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC10-208	ENST00000469856	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856		A0A1W2PQ67	120 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856		A0A1W2PRU2	124 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	VPS26A	O75436	327 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	ESR1	P03372	595 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	MC4R	P32245	332 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	HMGCL	P35914	325 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	ABL2	P42684	1182 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	PTGER3	P43115	390 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	COPA	P53621	1224 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	ERVK-21	P61565	698 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	CACNG1	Q06432	222 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	RAD51	Q06609	339 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	BCL2L1	Q07817	233 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	PTPRCAP	Q14761	206 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	HERC3	Q15034	1050 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	GPR158	Q5T848	1215 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	RNF135	Q8IUD6	432 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	EFHB	Q8N7U6	833 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	KDM1B	Q8NB78	822 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	LMLN	Q96KR4	655 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	CEP44	Q9C0F1	390 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	DPP7	Q9UHL4	492 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	OBSL1	O75147	1896 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	SYCE1L	A8MT33	242 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	GRM6	O15303	877 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	CCL16	O15467	120 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	KERA	O60938	352 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	XYLB	O75191	536 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	SLC4A1	P02730	911 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	RB1	P06400	928 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	CTNNB1	P35222	781 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	PGM1	P36871	562 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	PGGT1B	P53609	377 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	ERVFC1	P60507	584 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	SULT2A1	Q06520	285 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	NAA25	Q14CX7	972 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	APCDD1	Q8J025	514 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	AGAP11	Q8TF27	550 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	KCNJ9	Q92806	393 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	KIAA1191	Q96A73	305 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	OTUB2	Q96DC9	234 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	LYSMD1	Q96S90	227 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	ALG9	Q9H6U8	611 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	TLR9	Q9NR96	1032 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856		A0A0J9YYE9	177 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856		H3BMM5	538 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	CIB2	O75838	187 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	TM7SF2	O76062	418 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	TRBC1	P01850	177 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	THRA	P10827	490 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	SERPINA4	P29622	427 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	INHBC	P55103	352 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	HERVK_113	P63132	956 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	XIAP	P98170	497 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	KDSR	Q06136	332 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	KLF10	Q13118	480 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCC10-208	ENST00000469856	PEX6	Q13608	980 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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