RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 FGF1P05230 155 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 GNPDA1P46926 289 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 POLD2P49005 469 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 RPIAP49247 311 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 CLDN6P56747 220 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 DCDC1P59894 354 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 NR0B2Q15466 257 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 ALS2CLQ60I27 953 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 TAF8Q7Z7C8 310 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 SLC35F3Q8IY50 421 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 FAM71DQ8N9W8 422 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 GPR26Q8NDV2 337 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 COX14Q96I36 57 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 FICDQ9BVA6 458 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 CDH19Q9H159 772 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 SIRPGQ9P1W8 387 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 SUFUQ9UMX1 484 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 GPR34Q9UPC5 381 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 SCN8AQ9UQD0 1980 aa20.62■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 CPED1A4D0V7 1026 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 C5orf60A6NFR6 353 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 FADS2P1A8MWK0 482 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 AURKAO14965 403 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 FUCA1P04066 466 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 GP1BAP07359 652 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 IVLP07476 585 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 E2F1Q01094 437 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 TMPRSS12Q86WS5 348 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 ARL10Q8N8L6 244 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 CCL4L1Q8NHW4 92 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 IFI44Q8TCB0 444 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 GATA6Q92908 595 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 SPATA16Q9BXB7 569 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 TRABDQ9H4I3 376 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 HACD3Q9P035 362 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 SPEGQ15772 3267 aa20.61■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 CEP295Q9C0D2 2601 aa20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 FAM149AA5PLN7 773 aa20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 ASMTLO95671 621 aa20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 AGTP01019 485 aa20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 C1QTNF9P0C862 333 aa20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 BPIP17213 487 aa20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 GDF10P55107 478 aa20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 HES3Q5TGS1 186 aa20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 GUSBP11Q6P575 273 aa20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 TRAM1L1Q8N609 369 aa20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 KYQ8NBH2 561 aa20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 GSDMCQ9BYG8 508 aa20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 KCNF1Q9H3M0 494 aa20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 GULP1Q9UBP9 304 aa20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 ADRA1AP35348 466 aa20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 HMGCLP35914 325 aa20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 MARCH9Q86YJ5 346 aa20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 TTC30BQ8N4P2 665 aa20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 FAM46DQ8NEK8 389 aa20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 GPBAR1Q8TDU6 330 aa20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 OR2M4Q96R27 311 aa20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 APOL2Q9BQE5 337 aa20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 TLR10Q9BXR5 811 aa20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 BPIFA1Q9NP55 256 aa20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 VPS18Q9P253 973 aa20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 PADI4Q9UM07 663 aa20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 CHD8Q9HCK8 2581 aa20.58■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 TPRP12270 2363 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 ACACBO00763 2458 aa20.58■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 LIASO43766 372 aa20.58■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 JUPP14923 745 aa20.58■□□□□ 0.89
VARS-218ENST00000459667 OLIG2Q13516 323 aa20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms