RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 HACD1B0YJ81 288 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5-208ENST00000459627 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5-208ENST00000459627 ASMTLO95671 621 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5-208ENST00000459627 TEAD1P28347 426 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5-208ENST00000459627 WNT3AP56704 352 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5-208ENST00000459627 PROSER1Q86XN7 944 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5-208ENST00000459627 GPR26Q8NDV2 337 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5-208ENST00000459627 CCHCR1Q8TD31 782 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5-208ENST00000459627 HIC2Q96JB3 615 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5-208ENST00000459627 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
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SH3BP5-208ENST00000459627 FAM153AQ9UHL3 310 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5-208ENST00000459627 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5-208ENST00000459627 RAXQ9Y2V3 346 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP5-208ENST00000459627 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
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SH3BP5-208ENST00000459627 SLC30A9Q6PML9 568 aa23.76■■□□□ 1.39
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SH3BP5-208ENST00000459627 PTPN7P35236 360 aa23.75■■□□□ 1.39
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SH3BP5-208ENST00000459627 COX14Q96I36 57 aa23.75■■□□□ 1.39
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SH3BP5-208ENST00000459627 GUCA1BQ9UMX6 200 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 MTSS1O43312 755 aa23.74■■□□□ 1.39
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SH3BP5-208ENST00000459627 SLC14A2Q15849 920 aa23.74■■□□□ 1.39
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SH3BP5-208ENST00000459627 MAGEE1Q9HCI5 957 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 TAAR2Q9P1P5 351 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 KCNN4O15554 427 aa23.73■■□□□ 1.39
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SH3BP5-208ENST00000459627 GSDMDP57764 484 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 CCL7P80098 99 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.39
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SH3BP5-208ENST00000459627 BPIP17213 487 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 PSMB4P28070 264 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 CETN2P41208 172 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 C14orf28Q4W4Y0 310 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 PYCR3Q53H96 274 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 UBL4BQ8N7F7 174 aa23.72■■□□□ 1.39
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SH3BP5-208ENST00000459627 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 VAT1Q99536 393 aa23.72■■□□□ 1.39
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