RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 MTMR8Q96EF0 704 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 LINGO1Q96FE5 620 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 MBOAT7Q96N66 472 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 SEMA3CQ99985 751 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 RHOJQ9H4E5 214 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PDHXO00330 501 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 KCNQ2O43526 872 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ECHS1P30084 290 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PERM1Q5SV97 790 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CCDC107Q8WV48 283 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 SGCDQ92629 289 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 FCGR1BQ92637 280 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 C5orf34Q96MH7 638 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 RAB26Q9ULW5 256 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 DERAQ9Y315 318 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TRIM17Q9Y577 477 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ORC5O43913 435 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 NUAK1O60285 661 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ITGA2BP08514 1039 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ALDH4A1P30038 563 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CDH8P55286 799 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PARP15Q460N3 678 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 GPR156Q8NFN8 814 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 OR2L3Q8NG85 312 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ACER1Q8TDN7 264 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 STYXQ8WUJ0 223 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TLR10Q9BXR5 811 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 AASSQ9UDR5 926 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 NWD1Q149M9 1564 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 FFAR3O14843 346 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 GPR42O15529 346 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ENTPD5O75356 428 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 SH3BGRLO75368 114 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TULP3O75386 442 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TRMUO75648 421 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 MTHFRP42898 656 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 E2F2Q14209 437 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CNSTQ6PJW8 725 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 NUP54Q7Z3B4 507 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 MREGQ8N565 214 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 SNX33Q8WV41 574 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ZNF221Q9UK13 617 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 MYO5BQ9ULV0 1848 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 LIASO43766 372 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 KERAO60938 352 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TRBC1P01850 177 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 GPIP06744 558 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 MASP1P48740 699 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PPATQ06203 517 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 RAPSNQ13702 412 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ZBTB6Q15916 424 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 SNAPC1Q16533 368 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 EIPR1Q53HC9 387 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 C1orf189Q5VU69 101 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 MON1AQ86VX9 555 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 KAT7O95251 611 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 C9P02748 559 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PRH1P02810 166 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 MATKP42679 507 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 MAMLD1Q13495 774 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 DCST1Q5T197 706 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 C16orf46Q6P387 395 aa6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CPA6Q8N4T0 437 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms