RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438356.1

RBM33-208, Transcript of RNA binding motif protein 33, human

TSL 4

Gene RBM33, Length 547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM33-208	ENST00000438356	TRIM23	P36406	574 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	LMAN1	P49257	510 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	HK3	P52790	923 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	DPT	Q07507	201 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	IHH	Q14623	411 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	NLRP8	Q86W28	1048 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	TADA1	Q96BN2	335 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	TBATA	Q96M53	351 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	TRIB3	Q96RU7	358 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ABCG8	Q9H221	673 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF711	Q9Y462	761 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356		U3KQA8	63 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ITPR1	Q14643	2758 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	GCAT	O75600	419 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ASMTL	O95671	621 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	GAS8	O95995	478 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	FGG	P02679	453 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	C1S	P09871	688 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	PIRT	P0C851	137 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	CDK4	P11802	303 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ACP1	P24666	158 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	PSMB4	P28070	264 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	SPINT3	P49223	89 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	RPIA	P49247	311 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	CDK3	Q00526	305 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	PEX6	Q13608	980 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	PTPRR	Q15256	657 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	SLC1A5	Q15758	541 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	PARP6	Q2NL67	630 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	KDELC1	Q6UW63	502 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	PDZD3	Q86UT5	571 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	GKN2	Q86XP6	184 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	RBFA	Q8N0V3	343 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	OR4C6	Q8NH72	309 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	SCAMP4	Q969E2	229 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	PBK	Q96KB5	322 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	SMIM14	Q96QK8	99 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	FICD	Q9BVA6	458 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	TLR10	Q9BXR5	811 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	USP29	Q9HBJ7	922 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	DKK4	Q9UBT3	224 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	PKP3	Q9Y446	797 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		12	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	MYLK	Q15746	1914 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ATRX	P46100	2492 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356		A0A0U1RQS6	177 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	C2orf81	A6NN90	581 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356		E7EVH7	732 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356		K7ESM1	405 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	TPP1	O14773	563 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	LIAS	O43766	372 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	GM2A	P17900	193 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	ITPKB	P27987	946 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RBM33-208	ENST00000438356	C1orf61	Q13536	156 aa		11.99	□□□□□ -0.49

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