RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, human

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR1A-204	ENST00000424089	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	CNST	Q6PJW8	725 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	EPGN	Q6UW88	154 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	LONP2	Q86WA8	852 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	CEP97	Q8IW35	865 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	FGF13	Q92913	245 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	NXNL1	Q96CM4	212 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	TRMO	Q9BU70	441 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	GPAM	Q9HCL2	828 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		10.02	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089		H7C0S8	307 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	MATN2	O00339	956 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	HDAC3	O15379	428 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	GSC2	O15499	205 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	DLX3	O60479	287 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	TSPAN3	O60637	253 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	MAGEC1	O60732	1142 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	LRP3	O75074	770 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	C8A	P07357	584 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	SBK3	P0C264	359 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	IRF1	P10914	325 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	FDXR	P22570	491 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	PML	P29590	882 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	ABCG1	P45844	678 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	GRIA4	P48058	902 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	PLK1	P53350	603 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	NTHL1	P78549	312 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	TUBB3	Q13509	450 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	CDH18	Q13634	790 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	LEMD2	Q8NC56	503 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	NELL1	Q92832	810 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	CLDN23	Q96B33	292 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	TBATA	Q96M53	351 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	KXD1	Q9BQD3	176 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	IER2	Q9BTL4	223 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	PNPO	Q9NVS9	261 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	XPR1	Q9UBH6	696 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	VPS28	Q9UK41	221 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		10.01	□□□□□ -0.81
POLR1A-204	ENST00000424089	CPQ	Q9Y646	472 aa		10.01	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms