RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP6V1HQ9UI12 483 aa21.34■■□□□ 1.01
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PTPRJ-201ENST00000418331 CHST9Q7L1S5 443 aa21.34■■□□□ 1.01
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PTPRJ-201ENST00000418331 SIN3BO75182 1162 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 ITGA1P56199 1179 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 STX4Q12846 297 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP1A4Q13733 1029 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 SFRP1Q8N474 314 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 FITM2Q8N6M3 262 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 POMGNT2Q8NAT1 580 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 PLD4Q96BZ4 506 aa21.32■■□□□ 1
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