RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDC6Q99741 560 aa15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATA16Q9BXB7 569 aa15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VPS18Q9P253 973 aa15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCYOX1Q9UHG3 505 aa15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 APPL1Q9UKG1 709 aa15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM202A6NGA9 273 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNFP01375 233 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IVLP07476 585 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALPPL2P10696 532 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TPSB2P20231 275 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SARNPP82979 210 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ELOCQ15369 112 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TPSAB1Q15661 275 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALG11Q2TAA5 492 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARMC3Q5W041 872 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAPZA3Q96KX2 299 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VPS35Q96QK1 796 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AGAP2Q99490 1192 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DUSP23Q9BVJ7 150 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LGR4Q9BXB1 951 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RMI1Q9H9A7 625 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL26Q9NPH9 171 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CASS4Q9NQ75 786 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BOLA1Q9Y3E2 137 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEU2Q9Y3R4 380 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUP205Q92621 2012 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCDH15Q96QU1 1955 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TPP1O14773 563 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCAMP1O15126 338 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AQP9O43315 295 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SH3BP5O60239 455 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CBFA2T3O75081 653 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEACAM5P06731 702 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL9RQ01113 521 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BNIP3Q12983 259 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPS1Q13098 491 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OLIG2Q13516 323 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ITGA9Q13797 1035 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF542PQ5EBM4 170 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALS2CLQ60I27 953 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LVRNQ6Q4G3 990 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GLRX5Q86SX6 157 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRUNE1Q86TP1 453 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HID1Q8IV36 788 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A45Q8N413 288 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RHBDD1Q8TEB9 315 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR1E3Q8WZA6 343 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PEX13Q92968 403 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GLYATL1Q969I3 302 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RANBP9Q96S59 729 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FGF22Q9HCT0 170 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMOXQ9NWM0 555 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NLGN3Q9NZ94 848 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLF15Q9UIH9 416 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RIMKLBQ9ULI2 386 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARL5AQ9Y689 179 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 THADAQ6YHU6 1953 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRSS38A1L453 326 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HEATR9A2RTY3 570 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FADS2P1A8MWK0 482 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LMO7DNF2Z398 122 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LDB2O43679 373 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SDC3O75056 442 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTSEP14091 401 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSMA3P25788 255 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PEX6Q13608 980 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP1R7Q15435 360 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRRT3Q5FWE3 981 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NLRP9Q7RTR0 991 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GATAD2AQ86YP4 633 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR52K1Q8NGK4 314 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4C6Q8NH72 309 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STYXQ8WUJ0 223 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDXPQ96GD0 296 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRC61Q9BV99 259 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BPIFA1Q9NP55 256 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MROH6A6NGR9 719 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H7C0S8 307 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 INPP4BO15327 924 aa15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms