RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 TCEA2Q15560 299 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 PARP6Q2NL67 630 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC157Q569K6 752 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCTD11Q693B1 232 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 HIC2Q96JB3 615 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 BOCQ9BWV1 1114 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM168Q9H0V1 697 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDH19Q9H159 772 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 HACD3Q9P035 362 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 MOSPD1Q9UJG1 213 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 INPP4BO15327 924 aa21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZSCAN12O43309 604 aa21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 IVLP07476 585 aa21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 STIP1P31948 543 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 CXCR5P32302 372 aa21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 DAB2P98082 770 aa21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 ILKQ13418 452 aa21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 ALS2CLQ60I27 953 aa21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 LVRNQ6Q4G3 990 aa21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 DHRS13Q6UX07 377 aa21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 APOL2Q9BQE5 337 aa21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 RAD18Q9NS91 495 aa21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 KLK13Q9UKR3 277 aa21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 JRKLQ9Y4A0 524 aa21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 FGGP02679 453 aa21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 P3H1Q32P28 736 aa21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 DENND5AQ6IQ26 1287 aa21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 DOK6Q6PKX4 331 aa21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 GKN2Q86XP6 184 aa21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC35F3Q8IY50 421 aa21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRAM1L1Q8N609 369 aa21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCL4L1Q8NHW4 92 aa21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 BPIFA1Q9NP55 256 aa21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 IL17CQ9P0M4 197 aa21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 SUFUQ9UMX1 484 aa21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPEGQ15772 3267 aa21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM221BA6H8Z2 402 aa21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 CEP104O60308 925 aa21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 USP12O75317 370 aa21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 SNX1Q13596 522 aa21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPARCL1Q14515 664 aa21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 GSE1Q14687 1217 aa21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCNG2Q16589 344 aa21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBL1YQ9BQ87 522 aa21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPATA16Q9BXB7 569 aa21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARNT2Q9HBZ2 717 aa21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF148Q9UQR1 794 aa21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 SCN8AQ9UQD0 1980 aa21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 CDK4P11802 303 aa21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 GNPDA1P46926 289 aa21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF569Q5MCW4 686 aa21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 NRROSQ86YC3 692 aa21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC35F6Q8N357 371 aa21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 GPBAR1Q8TDU6 330 aa21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 VPS18Q9P253 973 aa21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 DOLKQ9UPQ8 538 aa21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 ST14Q9Y5Y6 855 aa21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 USP27XA6NNY8 438 aa21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 PYCR3Q53H96 274 aa21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 PDPK2PQ6A1A2 396 aa21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 TAF8Q7Z7C8 310 aa21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRUNE1Q86TP1 453 aa21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 GLIS1Q8NBF1 620 aa21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 DTX3LQ8TDB6 740 aa21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAIP1Q8WWC4 291 aa21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 IL26Q9NPH9 171 aa21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 MSRB2Q9Y3D2 182 aa21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 PTPRBP23467 1997 aa21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 BUD23O43709 281 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 DNAJC6O75061 913 aa21.84■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 IFNB1P01574 187 aa21.84■■□□□ 1.09
IGHV3-20-201ENST00000390606 ETS1P14921 441 aa21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms