RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTPRCP08575 1304 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 FLT1P17948 1338 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 AQP12BA6NM10 295 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 EFCAB8A8MWE9 144 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLOD2O00469 737 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SOCS3O14543 225 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 NGFP01138 241 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAF1P04049 648 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSF1P09603 554 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 FOLR2P14207 255 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 BCL3P20749 454 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RRM1P23921 792 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITGA3P26006 1051 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SERPINA4P29622 427 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSPA7P48741 367 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 AMPHP49418 695 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 NR1H2P55055 460 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLDN2P57739 230 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP12-4P60329 112 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 LYZP61626 148 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLIN5Q00G26 463 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SP3Q02447 781 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MBTD1Q05BQ5 628 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDCLQ13371 301 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF280DQ6N043 979 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 NFRKBQ6P4R8 1299 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 BRAT1Q6PJG6 821 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 NOXA1Q86UR1 476 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MARCH9Q86YJ5 346 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TCEAL8Q8IYN2 117 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 C17orf47Q8NEP4 570 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACVR1CQ8NER5 493 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR5R1Q8NH85 324 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 STAG1Q8WVM7 1258 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 BRI3BPQ8WY22 251 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RHBDF1Q96CC6 855 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 NSMCE3Q96MG7 304 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 QRFPRQ96P65 431 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 MXRA8Q9BRK3 442 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 RTKNQ9BST9 563 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 STK33Q9BYT3 514 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 BRD8Q9H0E9 1235 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLITRK2Q9H156 845 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMYD2Q9NRG4 433 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 BABAM1Q9NWV8 329 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 THEGQ9P2T0 379 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 B4GALT7Q9UBV7 327 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCND3Q9UK17 655 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC39A10Q9ULF5 831 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 TAF1P21675 1872 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRAG1Q86YV5 1406 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-170P-201ENST00000362832 UMODL1Q5DID0 1318 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLA2G6O60733 806 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDE9AO76083 593 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTA2O94776 668 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 AP2A2O94973 939 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 C22orf31O95567 290 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLDN1O95832 211 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 MELTFP08582 738 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 LIFP15018 202 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF23P17027 643 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTPN2P17706 415 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 EDN2P20800 178 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 MCCP23508 829 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNFSF4P23510 183 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 ELF1P32519 619 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 HNF1BP35680 557 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PNPLA4P41247 253 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTHFRP42898 656 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PNLIPRP1P54315 467 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 PAX8Q06710 450 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITGADQ13349 1161 aa0.46□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms