RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDKN2BP42772 138 aa22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAGEA1P43355 309 aa22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 INHBCP55103 352 aa22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 RPL26P61254 145 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 B4GALNT1Q00973 533 aa22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 NAGSQ8N159 534 aa22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPATA22Q8NHS9 363 aa22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR2M4Q96R27 311 aa22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRKAB1Q9Y478 270 aa22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 MGAQ8IWI9 3026 aa22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANKRD66B4E2M5 251 aa22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 B4GAT1O43505 415 aa22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC1A1P43005 524 aa22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPINT3P49223 89 aa22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR1D5P58170 312 aa22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 CXADRP78310 365 aa22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 PDK1Q15118 436 aa22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCSK7Q16549 785 aa22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 TAZQ16635 292 aa22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 PYCR3Q53H96 274 aa22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 RAB11FIP2Q7L804 512 aa22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 NRSN1Q8IZ57 195 aa22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARL14Q8N4G2 192 aa22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNE4Q8WWG9 221 aa22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 RDH14Q9HBH5 336 aa22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 CPNE5Q9HCH3 593 aa22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 ALG6Q9Y672 507 aa22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 KLK10O43240 276 aa22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 EML2O95834 649 aa22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC4A1P02730 911 aa22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 PNLIPP16233 465 aa22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 UGT1A5P35504 534 aa22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACTR1BP42025 376 aa22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACTR1AP61163 376 aa22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 KAZNQ674X7 775 aa22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF438Q7Z4V0 828 aa22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 CLEC14AQ86T13 490 aa22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 NLRP8Q86W28 1048 aa22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 TADA1Q96BN2 335 aa22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 SEMA6CQ9H3T2 930 aa22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLD2O14939 933 aa22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 CST8O60676 142 aa22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 DNAJC6O75061 913 aa22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 LCA5LO95447 670 aa22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 ASMTLO95671 621 aa22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 ITIH1P19827 911 aa22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 PTPN3P26045 913 aa22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCKBRP32239 447 aa22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 HADHBP55084 474 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 AMZ1Q400G9 498 aa22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 NT5DC3Q86UY8 548 aa22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLITRK4Q8IW52 837 aa22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 FBXO39Q8N4B4 442 aa22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 EXD1Q8NHP7 514 aa22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 NUDT22Q9BRQ3 303 aa22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDH19Q9H159 772 aa22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 UBP1Q9NZI7 540 aa22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 SHOC2Q9UQ13 582 aa22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 ATRXP46100 2492 aa22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 F5H423 210 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPM1DO15297 605 aa22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 ETV5P41161 510 aa22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 ODF2Q5BJF6 829 aa22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 ALS2CLQ60I27 953 aa22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 KRT35Q92764 455 aa22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 HAUS1Q96CS2 278 aa22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM74Q96NL1 305 aa22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 RBSNQ9H1K0 784 aa22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC25A51Q9H1U9 297 aa22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM83DQ9H4H8 585 aa22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 GLOD4Q9HC38 313 aa22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPO11Q9Y5K1 396 aa22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 RCCD1A6NED2 376 aa22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 RHPN2P1A8MT19 583 aa22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 PSTPIP1O43586 416 aa22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF25-201ENST00000348333 ITGA2BP08514 1039 aa22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms