RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 DIAPH2O60879 1101 aa26.7■■□□□ 1.86
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HOXD8-201ENST00000313173 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 STK40Q8N2I9 435 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
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HOXD8-201ENST00000313173 CCDC106Q9BWC9 280 aa26.7■■□□□ 1.86
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HOXD8-201ENST00000313173 CYP4F12Q9HCS2 524 aa26.69■■□□□ 1.86
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HOXD8-201ENST00000313173 FAM50BQ9Y247 325 aa26.69■■□□□ 1.86
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HOXD8-201ENST00000313173 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
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HOXD8-201ENST00000313173 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa26.67■■□□□ 1.86
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HOXD8-201ENST00000313173 ESR1P03372 595 aa26.67■■□□□ 1.86
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HOXD8-201ENST00000313173 NIPSNAP2O75323 286 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 IMPDH1P20839 514 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 TMC5Q6UXY8 1006 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 USP45Q70EL2 814 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 SNX20Q7Z614 316 aa26.65■■□□□ 1.86
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