RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278833.3

ROM1-201, Transcript of retinal outer segment membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ROM1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1-201ENST00000278833 TLR5O60602 858 aa24.96■■□□□ 1.59
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ROM1-201ENST00000278833 CDH4P55283 916 aa24.96■■□□□ 1.59
ROM1-201ENST00000278833 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
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ROM1-201ENST00000278833 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
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ROM1-201ENST00000278833 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
ROM1-201ENST00000278833 ARMC1Q9NVT9 282 aa24.96■■□□□ 1.59
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ROM1-201ENST00000278833 HSD17B1P14061 328 aa24.95■■□□□ 1.58
ROM1-201ENST00000278833 LRRC26Q2I0M4 334 aa24.95■■□□□ 1.58
ROM1-201ENST00000278833 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
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ROM1-201ENST00000278833 MIER2Q8N344 545 aa24.95■■□□□ 1.58
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ROM1-201ENST00000278833 A0A0J9YYE9 177 aa24.94■■□□□ 1.58
ROM1-201ENST00000278833 AQP12BA6NM10 295 aa24.94■■□□□ 1.58
ROM1-201ENST00000278833 SYCE1LA8MT33 242 aa24.94■■□□□ 1.58
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ROM1-201ENST00000278833 AQP12AQ8IXF9 295 aa24.94■■□□□ 1.58
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ROM1-201ENST00000278833 HMBSP08397 361 aa24.94■■□□□ 1.58
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ROM1-201ENST00000278833 TRIM15Q9C019 465 aa24.94■■□□□ 1.58
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ROM1-201ENST00000278833 OR2T3Q8NH03 318 aa24.93■■□□□ 1.58
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ROM1-201ENST00000278833 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
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ROM1-201ENST00000278833 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
ROM1-201ENST00000278833 DNMT3LQ9UJW3 386 aa24.93■■□□□ 1.58
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