RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 KCTD3Q9Y597 815 aa22.07■■□□□ 1.12
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HTATSF1-201ENST00000218364 TNFRSF10BO14763 440 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 ATE1O95260 518 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 VARSP26640 1264 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 GSK3BP49841 420 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC5A3P53794 718 aa22.06■■□□□ 1.12
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HTATSF1-201ENST00000218364 CYP51A1Q16850 503 aa22.06■■□□□ 1.12
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HTATSF1-201ENST00000218364 GEN1Q17RS7 908 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 DHRSXQ8N5I4 330 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.06■■□□□ 1.12
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HTATSF1-201ENST00000218364 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 KANSL1LA0AUZ9 987 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 C9JVG2 144 aa22.06■■□□□ 1.12
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HTATSF1-201ENST00000218364 PIK3R6Q5UE93 754 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 USP51Q70EK9 711 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA19Q7Z5L4 167 aa22.06■■□□□ 1.12
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF683Q8IZ20 524 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.06■■□□□ 1.12
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HTATSF1-201ENST00000218364 PEX13Q92968 403 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 HMCESQ96FZ2 354 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TBATAQ96M53 351 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM209Q96SK2 561 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF639Q9UID6 485 aa22.06■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 H3BMQ9 156 aa22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 CYBRD1Q53TN4 286 aa22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 AGMOQ6ZNB7 445 aa22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D21Q8IYX1 336 aa22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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HTATSF1-201ENST00000218364 COG8Q96MW5 612 aa22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 ALG2Q9H553 416 aa22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
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HTATSF1-201ENST00000218364 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 H3BMM5 538 aa22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 GLP2RO95838 553 aa22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 LINC00032P0C843 101 aa22.05■■□□□ 1.12
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HTATSF1-201ENST00000218364 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa22.04■■□□□ 1.12
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HTATSF1-201ENST00000218364 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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HTATSF1-201ENST00000218364 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 CLIC3O95833 236 aa22.04■■□□□ 1.12
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HTATSF1-201ENST00000218364 BRCC3P46736 316 aa22.04■■□□□ 1.12
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HTATSF1-201ENST00000218364 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 CLCQ05315 142 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 NFYCQ13952 458 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 BTRCQ9Y297 605 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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HTATSF1-201ENST00000218364 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 LIPEQ05469 1076 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 MRNIPQ6NTE8 343 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 AIG1Q9NVV5 245 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM248Q9NWD8 314 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.04■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 M0QZQ0 153 aa22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1-201ENST00000218364 GIPC1O14908 333 aa22.03■■□□□ 1.12
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