RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcbp2Q61990 362 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 XpaQ64267 272 aa22.02■■□□□ 1.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dnajc15Q78YY6 149 aa22.02■■□□□ 1.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mab21L3Q8CI17 429 aa22.02■■□□□ 1.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcolce2Q8R4W6 414 aa22.02■■□□□ 1.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cox18Q8VC74 331 aa22.02■■□□□ 1.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rprd1aQ8VDS4 312 aa22.02■■□□□ 1.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pycr2Q922Q4 320 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pinx1Q9CZX5 332 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wdr89Q9D0R9 386 aa22.02■■□□□ 1.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atad1Q9D5T0 361 aa22.02■■□□□ 1.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zscan12Q9Z1D7 501 aa22.02■■□□□ 1.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plxna4Q80UG2 1893 aa22.02■■□□□ 1.12
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dlx2P40764 332 aa22.02■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pnpla1Q3V1D5 599 aa22.02■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ces2bQ6PDB7 556 aa22.02■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr665Q8VG79 316 aa22.02■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lgals12Q91VD1 314 aa22.02■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Anks3Q9CZK6 655 aa22.02■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Neurl2Q9D0S4 285 aa22.02■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AcadsbQ9DBL1 432 aa22.02■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zscan4eA0A1B0GRE8 505 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr1200A2ATJ4 336 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ssxb6A2BI74 170 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 1600015I10RikE9Q745 711 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 F830016B08RikG3UWE2 416 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Il1rl1P14719 567 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Serpinb5P70124 375 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trmt10cQ3UFY8 414 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppm1hQ3UYC0 513 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zzz3Q6KAQ7 910 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam83eQ80XS7 481 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dennd1cQ8CFK6 786 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eva1bQ8K2Y3 164 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ClyblQ8R4N0 338 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atoh8Q99NA2 322 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 IgtpQ9DCE9 423 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyp3a44Q9EQW4 504 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NckipsdQ9ESJ4 714 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lama3Q61789 3330 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SmoktcrA2KF29 484 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm5415E9PXF3 478 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Erich1E9PY43 332 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rb1P13405 921 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 GhrP16882 650 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc2a3P32037 493 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chil6Q80W26 440 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcdh20Q8BIZ0 952 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ifi205aQ8CGE8 404 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hacd3Q8K2C9 362 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcdhgc3Q91XX1 934 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dio3Q91ZI8 304 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ndufaf7Q9CWG8 436 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ttc25Q9D4B2 624 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Spata1Q9D5R4 444 aa22.01■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CercamA3KGW5 592 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dthd1E9PZX1 795 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bcl7cO08664 217 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fmo5P97872 533 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tekt4Q149S1 447 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fubp3Q3TIX6 575 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CamkvQ3UHL1 512 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prss53Q571E5 552 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arhgap26Q6ZQ82 814 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf423Q80TS5 1292 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kirrel1Q80W68 789 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp6v1g3Q8BMC1 118 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mpp7Q8BVD5 576 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pi4k2bQ8CBQ5 469 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tp53bp2Q8CG79 1128 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nox1Q8CIZ9 591 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4933425L06RikQ9D3Z8 585 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CenpaO35216 134 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 BdnfP21237 249 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ClgnP52194 611 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arpp19P56212 112 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hcrtr1P58307 416 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 IqcmQ149I8 489 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SvoplQ6PDF3 494 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyp2c54Q6XVG2 490 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arhgap28Q8BN58 729 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc32Q8BS39 179 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem252Q8C353 183 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znrf4Q9DAH2 327 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc28a3Q9ERH8 703 aa22■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atg2aQ6P4T0 1914 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Il4i1O09046 630 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prox1P48437 737 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ezh1P70351 747 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pdcd2lQ8C5N5 364 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr589Q8VGV8 317 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dnajb4Q9D832 337 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc62E9PVD1 701 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Vmn2r120E9PX34 856 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sec22bO08547 215 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NadkP58058 439 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 WasP70315 520 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 F8a1Q00558 380 aa21.99■■□□□ 1.11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rab26Q504M8 260 aa21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.5 ms