RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MkksQ9JI70 570 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp4a12bA2A974 508 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cylc2B1AWN8 422 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zar1lC3VD30 291 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dthd1E9PZX1 795 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nlrp12E9Q5R7 1054 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sult2b1O35400 338 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CtswP56203 371 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tas2r16P59529 299 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ybx1P62960 322 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdh9P70407 786 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gsdmc2Q2KHK6 480 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snx21Q3UR97 363 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Afg1lQ3V384 480 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pacs2Q3V3Q7 862 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp22Q5DU02 525 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Creb3Q61817 404 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mef2dQ63943 514 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klhl42Q8BFQ9 493 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gsdmc3Q8CB12 480 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Akr1c13Q8VC28 323 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp4a12aQ91WL5 508 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdhgc3Q91XX1 934 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gins4Q99LZ3 223 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ninj2Q9JL89 143 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hs6st1Q9QYK5 411 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CtsjQ9R014 334 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Insl5Q9WUG6 135 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrpl40Q9Z2Q5 206 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4921501E09RikA0A0R4J054 908 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm12800B1AUV4 484 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8369E9PZI3 166 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm12794L7MTS5 483 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r57L7N269 863 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd151O35566 253 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clec1aQ8BWY2 269 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ttc34Q8C0Q3 554 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxo48Q8CAT8 161 aa16.03■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21083A0A0G2JFD5 256 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8237E9Q257 205 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atn1O35126 1175 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nat1P50294 290 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pip5k1bP70181 539 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Txnl4aP83877 142 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem173Q3TBT3 378 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp4f37Q3V1F1 546 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Afap1l2Q5DTU0 825 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrrc8bQ5DU41 803 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MafkQ61827 156 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Stmnd1Q6P3A1 279 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eif2s1Q6ZWX6 315 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrps35Q8BJZ4 320 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nipal1Q8BMW7 416 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam78aQ8C552 283 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp45Q8K387 813 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trpv3Q8K424 791 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hid1Q8R1F6 788 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sh3d19Q91X43 789 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc77Q9CZH8 489 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pias4Q9JM05 507 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dctn3Q9Z0Y1 186 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm13128L7MU96 475 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dlx2P40764 332 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CtscP97821 462 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smpd1Q04519 627 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt80Q0VBK2 452 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 G2e3Q5RJY2 716 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lcp1Q61233 627 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klhl23Q6GQU2 558 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rundc3bQ6PDC0 408 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 UstQ8BUB6 407 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slfn5Q8CBA2 884 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CasrQ9QY96 1079 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxo17Q9QZM8 286 aa16.02■□□□□ 0.16
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm4871D3Z0W7 314 aa16.02■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r76F8VQ63 324 aa16.02■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GhrP16882 650 aa16.02■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 S100a9P31725 113 aa16.02■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd86P42082 309 aa16.02■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 St14P56677 855 aa16.02■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zmat1Q3V0C1 714 aa16.02■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pnpla1Q3V1D5 599 aa16.02■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Crtc1Q68ED7 630 aa16.02■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RadilQ69Z89 1099 aa16.02■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clec7aQ6QLQ4 244 aa16.02■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lsm14aQ8K2F8 462 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ankrd61Q9CQM6 421 aa16.02■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dlgap1Q9D415 992 aa16.02■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tor1bQ9ER41 336 aa16.02■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hipk3Q9ERH7 1192 aa16.02■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cldn19Q9ET38 224 aa16.02■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klhdc7bA0A286YD60 1263 aa16.01■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4930426L09RikE9Q0N7 123 aa16.01■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim15G3UY57 292 aa16.01■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc2a4P14142 509 aa16.01■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GemP55041 295 aa16.01■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AnpepP97449 966 aa16.01■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim40Q3UWA4 246 aa16.01■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnfaip2Q61333 691 aa16.01■□□□□ 0.15
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Far2Q7TNT2 515 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 51.5 ms