RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lag3Q61790 521 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Proser3Q7TSA6 634 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Disc1Q811T9 852 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc41a1Q8BJA2 512 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gtf3c4Q8BMQ2 817 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zc2hc1cQ8CCG1 527 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cog4Q8R1U1 785 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r18Q8R2C8 299 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hddc3Q9D114 179 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Agpat3Q9D517 376 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MecrQ9DCS3 373 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cldn19Q9ET38 224 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stk19Q9JHN8 254 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cacna1cQ01815 2139 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhdc7bA0A286YD60 1263 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cilp2D3Z7H8 1162 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2j12G3UXT0 502 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LifP09056 203 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gabrb3P63080 473 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ctnnb1Q02248 781 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptchd3Q0EEE2 906 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp217Q3U0X6 1041 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ephx3Q3V1F8 367 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5431Q5NCB3 844 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hsfy2Q80Y37 392 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fstl5Q8BFR2 847 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rap2cQ8BU31 183 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Anapc2Q8BZQ7 837 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adam33Q923W9 797 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf31Q924T7 1066 aa12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 VapbQ9QY76 243 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp626A0A0U1RQ84 676 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cldn24D3YXJ9 220 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpine3E9Q6A2 401 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r14E9Q759 848 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm43302L7N1X8 611 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ap3d1O54774 1199 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sp1O89090 784 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MaptP10637 733 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gja1P23242 382 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps4bP46467 444 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gbp10Q000W5 611 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam160a1Q505K2 1081 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtnr1aQ61184 353 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arnt2Q61324 712 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxj1Q61660 421 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dlx3Q64205 287 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp11bQ6DFW5 1175 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q6PAC4 1279 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dclk2Q6PGN3 756 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem121Q80XA0 318 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tgm6Q8BM11 706 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rmdn2Q8BSE0 410 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc90bQ8C3X2 256 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zdhhc12Q8VC90 267 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hacd2Q9D3B1 254 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 S100pbpQ9D5K4 396 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clca1Q9D7Z6 913 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifrd2Q9D8U0 441 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CrotQ9DC50 612 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm12695A2AGB2 545 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phf11A6H5X4 337 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem240B2RWJ3 173 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb10E9Q8X5 861 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr603L7N1Y4 312 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fgf10O35565 209 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stat5aP42230 793 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tlx1P43345 332 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sipa1P46062 1037 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kir3dl1P83555 432 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp5jP97450 108 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eps8Q08509 821 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ntrk1Q3UFB7 799 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cog7Q3UM29 770 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q3V0E1 1183 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HltfQ6PCN7 1003 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ChfrQ810L3 664 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Samd4aQ8CBY1 711 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb9Q8CDC7 459 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nsl1Q8K305 281 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddx18Q8K363 660 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adgrf1Q8VEC3 908 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr697Q8VFM4 317 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr589Q8VGV8 317 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DdoQ922Z0 341 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcf7l2Q924A0 459 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Neurl2Q9D0S4 285 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ubqln5Q9D4I8 510 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf11Q9QYK7 154 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CdylQ9WTK2 593 aa12.63□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nhsl2B1AXH1 854 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r115E9Q0E7 857 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r65G3X931 845 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ring1O35730 406 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Top3aO70157 1003 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SpnP15702 395 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il6raP22272 460 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tead2P48301 445 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lman2lP59481 347 aa12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.6 ms