RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 EFCAB10A6NFE3 127 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 GRIA3P42263 894 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF563Q8TA94 476 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 NMUR1Q9HB89 426 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 CD84Q9UIB8 345 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 UGT2B15P54855 530 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PSME3P61289 254 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 TNK2Q07912 1038 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 SLC20A2Q08357 652 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 OLFM1Q99784 485 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 CAB39LQ9H9S4 337 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHGC3Q9UN70 934 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 MGRN1O60291 552 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 BCL10O95999 233 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 IGFALSP35858 605 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 BST1Q10588 318 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 HECTD2Q5U5R9 776 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 FAM171BQ6P995 826 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 C12orf42Q96LP6 360 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 CLN6Q9NWW5 311 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PMF1Q6P1K2 205 aa20.14■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 CNPPD1Q9BV87 410 aa20.14■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.14■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa20.14■□□□□ 0.82
CTDP1-208ENST00000613122 CMPK1P30085 196 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 VITQ6UXI7 678 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 IZUMO1Q8IYV9 350 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 NBNO60934 754 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 ALPPL2P10696 532 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 CDH3P22223 829 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 AP1S1P61966 158 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 BNC1Q01954 994 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 DSC2Q02487 901 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 CCL14Q16627 93 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 DUPD1Q68J44 220 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 TAC4Q86UU9 113 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 Q96MT0 163 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 GBA3Q9H227 469 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 WNT7AO00755 349 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 TNFAIP8O95379 198 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 MED26O95402 600 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 C10orf107Q8IVU9 208 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 OR7D4Q8NG98 312 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 GGA2Q9UJY4 613 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 RGSL1A5PLK6 1076 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 ARVCFO00192 962 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 ALOX15BO15296 676 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 TPSB2P20231 275 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 TMED10P49755 219 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 SEMA5AQ13591 1074 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 TPSAB1Q15661 275 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 PWWP2AQ96N64 755 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 IL12RB2Q99665 862 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 FGFR3P22607 806 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 DPEP2Q9H4A9 486 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 MKL2Q9ULH7 1088 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 SLC6A2P23975 617 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 CYP4F8P98187 520 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 NR1D2Q14995 579 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 LMLNQ96KR4 655 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 NDST2P52849 883 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 SPIBQ01892 262 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 CPTPQ5TA50 214 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 DEF8Q6ZN54 512 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 MIEF2Q96C03 454 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 BRINP2Q9C0B6 783 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 INSIG1O15503 277 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 OR10H3O60404 316 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 AKT2P31751 481 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 HMCESQ96FZ2 354 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 GRIP2Q9C0E4 1043 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 TLE2Q04725 743 aa20.12■□□□□ 0.81
CTDP1-208ENST00000613122 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms