RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599909.1

RPS5-208, Transcript of ribosomal protein S5, human

TSL 2

Gene RPS5, Length 523 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS5-208	ENST00000599909	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	TEAD1	P28347	426 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	GPR1	P46091	355 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	TLE1	Q04724	770 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	DPYSL2	Q16555	572 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	COLEC12	Q5KU26	742 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF653	Q96CK0	615 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	SCRN2	Q96FV2	425 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	OR2M4	Q96R27	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	CDH19	Q9H159	772 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	ZWILCH	Q9H900	591 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	EFCAB7	A8K855	629 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	ZW10	O43264	779 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	RAD1	O60671	282 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	EML2	O95834	649 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	PDHA1	P08559	390 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	MMP13	P45452	471 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	POLE2	P56282	527 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	DPT	Q07507	201 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	SQSTM1	Q13501	440 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	PYCR3	Q53H96	274 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	LRRC66	Q68CR7	880 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	ANKS6	Q68DC2	871 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	BORA	Q6PGQ7	559 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	USP45	Q70EL2	814 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	FAM129C	Q86XR2	697 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	BMPER	Q8N8U9	685 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	HSPH1	Q92598	858 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	SCAMP4	Q969E2	229 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	AGAP2	Q99490	1192 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	DDA1	Q9BW61	102 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	ABCG8	Q9H221	673 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	ANO10	Q9NW15	660 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	MYO6	Q9UM54	1294 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RPS5-208	ENST00000599909		B4E171	279 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63	5e-57	■■■□□ 18.5
RPS5-208	ENST00000599909	DUX1	O43812	170 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	FZD6	O60353	706 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	MAP3K6	O95382	1288 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	NFKBIA	P25963	317 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	PCK1	P35558	622 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ARL4A	P40617	200 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	TSPAN7	P41732	249 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	FASLG	P48023	281 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	GPLD1	P80108	840 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	KCNAB2	Q13303	367 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	IHH	Q14623	411 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ASIC2	Q16515	512 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	STX1A	Q16623	288 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	MARC1	Q5VT66	337 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	BBS5	Q8N3I7	341 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	AP2M1	Q96CW1	435 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	CTRC	Q99895	268 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	ZMYND15	Q9H091	742 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS5-208	ENST00000599909	EPN3	Q9H201	632 aa		11.14	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms