RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596778.1

AC003973.2-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC003973.2, Length 1,394 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC003973.2-201ENST00000596778 TM9SF3Q9HD45 589 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 CACNA1EQ15878 2313 aa6.65□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 THADAQ6YHU6 1953 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PIEZO1Q92508 2521 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 FAM187AA6NFU0 413 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 IGLON5A6NGN9 336 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 A6NNZ2 444 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 AGAP14A8MT82 685 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PLK4O00444 970 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 FPGTO14772 594 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 TNFRSF10CO14798 259 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 WNT9AO14904 365 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PMPCBO75439 489 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 FSBPO95073 299 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PCDH8O95206 1070 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 IFNB1P01574 187 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 SYPP08247 313 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 GPR89BP0CG08 455 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 TSHRP16473 764 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 ITPKAP23677 461 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 CD38P28907 300 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PLA2G5P39877 138 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PTGIRP43119 386 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 MAGEA3P43357 314 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 RXRGP48443 463 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 SPINT3P49223 89 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 DRG2P55039 364 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 FAM193AP78312 1265 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 SARNPP82979 210 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 ACVR1Q04771 509 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 CDH17Q12864 832 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 SLC14A1Q13336 389 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 SNX1Q13596 522 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 FGL2Q14314 439 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 STAT4Q14765 748 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 LRRC14Q15048 493 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 POM121L1PQ3SYA9 428 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 SEL1L3Q68CR1 1132 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 LRRC66Q68CR7 880 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 GSTA5Q7RTV2 222 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 ZNF511Q8NB15 262 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 MNS1Q8NEH6 495 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 IPMKQ8NFU5 416 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 RMDN1Q96DB5 314 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 SERAC1Q96JX3 654 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 VPS35Q96QK1 796 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 C10orf88Q9H8K7 445 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 CASS4Q9NQ75 786 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 IL17CQ9P0M4 197 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 ZNF711Q9Y462 761 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.64□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 PLXNA2O75051 1894 aa6.63□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 TRPM6Q9BX84 2022 aa6.63□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 NUMA1Q14980 2115 aa6.63□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa6.63□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 MAGEB16A2A368 324 aa6.63□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 MROH6A6NGR9 719 aa6.63□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 C2orf81A6NN90 581 aa6.63□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 TLR4O00206 839 aa6.63□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 GIPC1O14908 333 aa6.63□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 MMP20O60882 483 aa6.63□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
AC003973.2-201ENST00000596778 CRTAMO95727 393 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.2 ms