RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 DPYSL5Q9BPU6 564 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 DDA1Q9BW61 102 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 ZWILCHQ9H900 591 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 NOD2Q9HC29 1040 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 B4E171 279 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 H3BRJ5 948 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 MAFKO60675 156 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 PGLSO95336 258 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 SOD1P00441 154 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 MPSTP25325 297 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 TSPAN7P41732 249 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR1P46091 355 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 FASLGP48023 281 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 POLE2P56282 527 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 RAB15P59190 212 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 MAXP61244 160 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 GPLD1P80108 840 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 TLE1Q04724 770 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 PTPRRQ15256 657 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 DPYSL2Q16555 572 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 COLEC12Q5KU26 742 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 ARMC12Q5T9G4 340 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM71Q6P5X7 295 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 DOK6Q6PKX4 331 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 RFLNAQ6ZTI6 216 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 USP45Q70EL2 814 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 BBS5Q8N3I7 341 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 OR2M4Q96R27 311 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 HSD3B7Q9H2F3 369 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 ETNK2Q9NVF9 386 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 OCIAD1Q9NX40 245 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC39A1Q9NY26 324 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNK4Q9NYG8 393 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM9Q9P0T7 183 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 TUBD1Q9UJT1 453 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 MYO6Q9UM54 1294 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 PPIL1Q9Y3C6 166 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A0U1RQS6 177 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 EFCAB7A8K855 629 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 RAD1O60671 282 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 GZMAP12544 262 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 AMPD1P23109 780 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 IL1R2P27930 398 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 PCK1P35558 622 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 ARL4AP40617 200 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 MMP13P45452 471 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNAB2Q13303 367 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 LRP8Q14114 963 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 SMTNL2Q2TAL5 461 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 PYCR3Q53H96 274 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 DCAF12Q5T6F0 453 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 TMCO3Q6UWJ1 677 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 POLNQ7Z5Q5 900 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM129CQ86XR2 697 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 SFRP1Q8N474 314 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 ATPAF2Q8N5M1 289 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 BMPERQ8N8U9 685 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC37A2Q8TED4 501 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 NSMCE1Q8WV22 266 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 PIH1D2Q8WWB5 315 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 AP2M1Q96CW1 435 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 CATSPER2Q96P56 530 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 ABCG8Q9H221 673 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 LMBRD1Q9NUN5 540 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 ANO10Q9NW15 660 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 PDP2Q9P2J9 529 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 CD84Q9UIB8 345 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 PILRAQ9UKJ1 303 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC53A6NM62 1247 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 DUX1O43812 170 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 FZD6O60353 706 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 FTLP02792 175 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 PDHA1P08559 390 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 TCF4P15884 667 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF30P17039 623 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 CTPS1P17812 591 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 CCR10P46092 362 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 CDH6P55285 790 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 PTSQ03393 145 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 NCAPHQ15003 741 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 MARC1Q5VT66 337 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC66Q68CR7 880 aa10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms