RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa21.32■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 ADCY4Q8NFM4 1077 aa21.32■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 OR2T12Q8NG77 320 aa21.32■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 NAT14Q8WUY8 206 aa21.32■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 PDCD10Q9BUL8 212 aa21.32■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 TP73O15350 636 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF24P17028 368 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 SLC6A2P23975 617 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 OTOP3Q7RTS5 596 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 AP3S1Q92572 193 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF558Q96NG5 402 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CPXM1Q96SM3 734 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 RACGAP1Q9H0H5 632 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 NOL4O94818 638 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 RIPK1Q13546 671 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 STX12Q86Y82 276 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 SLC28A2O43868 658 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 C2P06681 752 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 MMP8P22894 467 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 RHAGQ02094 409 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 RALGDSQ12967 914 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 STRADAQ7RTN6 431 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CHPFQ8IZ52 775 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 DSELQ8IZU8 1212 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF607Q96SK3 696 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 COQ6Q9Y2Z9 468 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 PPLO60437 1756 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 MATN2O00339 956 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 AREL1O15033 823 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 ATP6V1G1O75348 118 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINB7O75635 380 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 TRMUO75648 421 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 FADS2O95864 444 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 ECDO95905 644 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 BMP7P18075 431 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 MON1BQ7L1V2 547 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 TRMOQ9BU70 441 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 ASAH2Q9NR71 780 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 AP3D1O14617 1153 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 OR10H2O60403 315 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 IL18R1Q13478 541 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 TYSND1Q2T9J0 566 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 PIH1D2Q8WWB5 315 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CLIP3Q96DZ5 547 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 SOHLH2Q9NX45 425 aa21.31■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 FOXO6A8MYZ6 492 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 MFSD11O43934 449 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 LRIG2O94898 1065 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 FSTL1Q12841 308 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 BLMHQ13867 455 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CLHC1Q8NHS4 586 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CPT1BQ92523 772 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 DPF3Q92784 378 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 PPCDCQ96CD2 204 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 GIT1Q9Y2X7 761 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 DERAQ9Y315 318 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 U3KQV3 271 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 UGT2B11O75310 529 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 TM7SF2O76062 418 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 MTHFRP42898 656 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 BCAP31P51572 246 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CXorf40BQ96DE9 158 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 BCL2L14Q9BZR8 327 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CAPN8A6NHC0 703 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 IRF6O14896 467 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 MGRN1O60291 552 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CHRNGP07510 517 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CD52P31358 61 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 BTBD9Q96Q07 612 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 RPS6KA3P51812 740 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 BNIP1Q12981 228 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 MCFD2Q8NI22 146 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 FERD3LQ96RJ6 166 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 OR10H1Q9Y4A9 318 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC189A1A4V9 331 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 H0Y858 1186 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 IPO13O94829 963 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 TOMM20Q15388 145 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 GALNT5Q7Z7M9 940 aa21.3■■□□□ 1
PTPRM-211ENST00000580170 C7orf26Q96N11 449 aa21.3■■□□□ 1
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