RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579916.5

CCDC178-208, Transcript of coiled-coil domain containing 178, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC178, Length 1,017 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC178-208	ENST00000579916	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916		A8MVJ9	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	ANHX	E9PGG2	379 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916		H0YCG3	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916		K7ENM7	598 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	CES2	O00748	559 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	PRRG1	O14668	218 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	TP73	O15350	636 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	CLDN3	O15551	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	PI15	O43692	258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	TOM1L1	O75674	476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	BMP15	O95972	392 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	MT-CO3	P00414	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	CXCL8	P10145	99 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	HGF	P14210	728 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	KCNE1	P15382	129 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	TPH1	P17752	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	AOC1	P19801	751 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	HOXA9	P31269	272 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	UBA7	P41226	1012 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	LIG4	P49917	911 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	ARPP19	P56211	112 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	ROR1	Q01973	937 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	HTR4	Q13639	388 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	XKR4	Q5GH76	650 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	GPBP1	Q86WP2	473 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	FGF13	Q92913	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	SNX22	Q96L94	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	AK8	Q96MA6	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	WNT16	Q9UBV4	365 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	CDH7	Q9ULB5	785 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916		F8W8V4	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	RAB27B	O00194	218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	SYN3	O14994	580 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	CLTA	P09496	248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	CD19	P15391	556 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	CREB1	P16220	341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	ELF1	P32519	619 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	TNFSF9	P41273	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	SPAG1	Q07617	926 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	MTSS1L	Q765P7	747 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	ITFG1	Q8TB96	612 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	ING5	Q8WYH8	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	RAD54L	Q92698	747 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	FGF14	Q92915	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	KXD1	Q9BQD3	176 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCDC178-208	ENST00000579916	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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