RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	APBA1	Q02410	837 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	TEK	Q02763	1124 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	SULT2A1	Q06520	285 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	NME3	Q13232	169 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	PNOC	Q13519	176 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	SPIDR	Q14159	915 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	IGFBP7	Q16270	282 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	TBR1	Q16650	682 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	NEK5	Q6P3R8	708 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	USP53	Q70EK8	1073 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	PASD1	Q8IV76	773 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	ARL14	Q8N4G2	192 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	SGF29	Q96ES7	293 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	PDXP	Q96GD0	296 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	CPXM1	Q96SM3	734 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	DNAJC7	Q99615	494 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	PISD	Q9UG56	409 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	NOTCH2	Q04721	2471 aa		4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	BECN2	A8MW95	431 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	LMO7DN	F2Z398	122 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	FPGT	O14772	594 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	TPP1	O14773	563 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	AURKA	O14965	403 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	THAP12	O43422	761 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	AP1G1	O43747	822 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	STX10	O60499	249 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	CLDN11	O75508	207 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	DAB1	O75553	588 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	MYL1	P05976	194 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	RNF224	P0DH78	156 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	KRT5	P13647	590 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	RAC2	P15153	192 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	CR2	P20023	1033 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	L1CAM	P32004	1257 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	CCKBR	P32239	447 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	CCR1	P32246	355 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	ACVRL1	P37023	503 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
PTPRM-206	ENST00000578093	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77

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